247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2703 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2703  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2920  protein of unknown function DUF161  55.17 
 
 
303 aa  309  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000232125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  53.31 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  47.75 
 
 
281 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  41.92 
 
 
283 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  45.8 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  46.5 
 
 
286 aa  231  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  41.03 
 
 
287 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  44.52 
 
 
278 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  43.79 
 
 
281 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  38.91 
 
 
295 aa  208  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  38.83 
 
 
311 aa  205  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  36.65 
 
 
292 aa  198  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  40.07 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0203  hypothetical protein  37.37 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3006  protein of unknown function DUF161  40.07 
 
 
286 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000192497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2546  hypothetical protein  40.48 
 
 
294 aa  192  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000203917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  35.96 
 
 
289 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  35.62 
 
 
290 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  37.5 
 
 
288 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0196  hypothetical protein  35.29 
 
 
278 aa  185  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0234  yitT family protein  35.29 
 
 
278 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0253  yitT family protein  35.29 
 
 
278 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5091  yitT family protein  35.29 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0228  yitT family protein  34.95 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0210  yitT family protein  34.95 
 
 
278 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0196  hypothetical protein  34.95 
 
 
278 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.851419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0200  hypothetical protein  34.95 
 
 
278 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0218  yitT family protein  34.95 
 
 
278 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0235  yitT family protein  34.95 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  35.29 
 
 
299 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2215  protein of unknown function DUF161  41.24 
 
 
294 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00368135  hitchhiker  0.000374105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  36.9 
 
 
298 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  34.74 
 
 
294 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  35.07 
 
 
293 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  34.72 
 
 
293 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  34.72 
 
 
293 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  34.72 
 
 
293 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  34.72 
 
 
293 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  34.72 
 
 
293 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  34.72 
 
 
293 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3191  Protein of unknown function DUF2179  39.16 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  34.03 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  34.58 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  34.03 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  34 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  35.29 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  33.8 
 
 
304 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  33.67 
 
 
285 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0290  hypothetical protein  36.39 
 
 
285 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000120699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  36.86 
 
 
288 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  34.38 
 
 
293 aa  168  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0295  hypothetical protein  36.05 
 
 
285 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0305  hypothetical protein  34.03 
 
 
277 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0748  hypothetical protein  34.01 
 
 
283 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0644757  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1288  protein of unknown function DUF161  34.34 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  34.72 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  33.11 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  34.83 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0684  hypothetical protein  34.38 
 
 
277 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0669  hypothetical protein  34.38 
 
 
277 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.866307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2616  protein of unknown function DUF161  36.27 
 
 
288 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000720176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  35.42 
 
 
293 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3010  hypothetical protein  35.19 
 
 
292 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0879703  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  32.78 
 
 
285 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2267  protein of unknown function DUF161  36.61 
 
 
299 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1419  hypothetical protein  36.43 
 
 
273 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  32.98 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0907  hypothetical protein  34.02 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00009581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3566  protein of unknown function DUF161  36.24 
 
 
288 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332576  normal  0.685125 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  34.04 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0748  hypothetical protein  30.2 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.796789  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  32.39 
 
 
287 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  32.88 
 
 
288 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  32.12 
 
 
296 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3254  hypothetical protein  34.97 
 
 
279 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1039  hypothetical protein  29.47 
 
 
315 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3284  hypothetical protein  34.97 
 
 
279 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.565823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4135  hypothetical protein  35.19 
 
 
292 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0943435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1996  hypothetical protein  34.97 
 
 
279 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0836  hypothetical protein  34.84 
 
 
292 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00175288  hitchhiker  0.00000155404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2979  hypothetical protein  34.97 
 
 
279 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.034636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3033  hypothetical protein  34.62 
 
 
279 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.238411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3014  hypothetical protein  34.62 
 
 
279 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.098054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3266  hypothetical protein  34.62 
 
 
279 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4400  hypothetical protein  34.84 
 
 
292 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3259  hypothetical protein  34.62 
 
 
279 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2954  hypothetical protein  34.62 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645882  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0885  protein of unknown function DUF161  33.91 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000434482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4362  hypothetical protein  35.19 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0124376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4184  hypothetical protein  35.19 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4304  YqfU  35.19 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75009e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4022  hypothetical protein  35.19 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000230064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4032  hypothetical protein  35.19 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00528347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4416  hypothetical protein  35.19 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4506  hypothetical protein  35.19 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0062877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  30.96 
 
 
297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  31.67 
 
 
297 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  31.67 
 
 
297 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  31.67 
 
 
297 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>