25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0063 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0063  outer membrane efflux protein  100 
 
 
392 aa  799  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.28 
 
 
1469 aa  70.5  5e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  22.06 
 
 
472 aa  68.9  1e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.81 
 
 
1450 aa  67.8  3e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
431 aa  67  6e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.35 
 
 
428 aa  65.1  2e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  22.03 
 
 
1459 aa  59.3  1e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 
432 aa  58.9  2e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 
413 aa  56.6  8e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  20.55 
 
 
1456 aa  55.8  1e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.3 
 
 
437 aa  55.1  2e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.64 
 
 
434 aa  53.5  6e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 
432 aa  53.1  7e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 
432 aa  51.6  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  26.46 
 
 
488 aa  50.1  7e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  21.33 
 
 
1455 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  25.12 
 
 
481 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3358  outer membrane efflux family protein, putative  26.4 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.75 
 
 
1443 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.76 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  5.96226e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  27.42 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.13 
 
 
518 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4083  outer membrane efflux family protein, putative  24.13 
 
 
443 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>