291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2321 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  100 
 
 
167 aa  339  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  96.41 
 
 
167 aa  328  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  89.82 
 
 
167 aa  310  5e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  87.43 
 
 
167 aa  301  2e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  79.04 
 
 
168 aa  275  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  79.04 
 
 
168 aa  275  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  79.04 
 
 
168 aa  275  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  79.04 
 
 
168 aa  275  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  79.04 
 
 
168 aa  275  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  79.64 
 
 
168 aa  275  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  79.04 
 
 
168 aa  275  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  79.04 
 
 
168 aa  275  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  78.44 
 
 
168 aa  273  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  78.44 
 
 
168 aa  273  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  78.44 
 
 
167 aa  271  4e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  78.44 
 
 
167 aa  271  4e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  78.44 
 
 
167 aa  270  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  77.84 
 
 
168 aa  270  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  77.84 
 
 
168 aa  270  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  77.84 
 
 
168 aa  270  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  77.84 
 
 
168 aa  270  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  77.84 
 
 
168 aa  270  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  73.05 
 
 
166 aa  245  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  71.08 
 
 
166 aa  239  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  70.66 
 
 
166 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  70.06 
 
 
166 aa  235  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  70.06 
 
 
166 aa  234  5e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  70.06 
 
 
166 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  68.86 
 
 
166 aa  232  2e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  71.08 
 
 
165 aa  232  2e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  69.88 
 
 
165 aa  228  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.07 
 
 
166 aa  223  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  66.87 
 
 
165 aa  222  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  65.24 
 
 
166 aa  214  3e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2432  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  68.26 
 
 
166 aa  214  3e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.399489 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.96 
 
 
165 aa  213  9e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  65.85 
 
 
166 aa  212  2e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  63.64 
 
 
166 aa  211  4e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  61.08 
 
 
166 aa  210  8e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  60.48 
 
 
166 aa  208  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  63.41 
 
 
166 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  63.8 
 
 
166 aa  207  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  62.2 
 
 
166 aa  206  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  60.71 
 
 
167 aa  206  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  59.88 
 
 
166 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  59.52 
 
 
167 aa  204  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  59.52 
 
 
167 aa  204  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  59.52 
 
 
167 aa  204  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  59.52 
 
 
167 aa  204  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  59.52 
 
 
167 aa  204  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  59.52 
 
 
167 aa  204  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  60.71 
 
 
167 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  60.71 
 
 
167 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  58.93 
 
 
167 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  59.88 
 
 
187 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  59.52 
 
 
167 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  59.28 
 
 
167 aa  199  1e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  61.35 
 
 
163 aa  199  1e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  59.28 
 
 
167 aa  199  1e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  59.52 
 
 
167 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  59.52 
 
 
167 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  59.52 
 
 
167 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  58.79 
 
 
179 aa  197  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  57.06 
 
 
166 aa  197  8e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  58.93 
 
 
167 aa  196  1e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  57.32 
 
 
187 aa  194  4e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  61.64 
 
 
166 aa  194  4e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  56.63 
 
 
173 aa  193  8e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  58.13 
 
 
166 aa  193  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  57.23 
 
 
166 aa  191  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  55.83 
 
 
165 aa  191  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  55.83 
 
 
166 aa  190  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  57.93 
 
 
166 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  55.21 
 
 
167 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  55.69 
 
 
166 aa  185  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  6.63162e-11  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  54.82 
 
 
168 aa  184  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  56.44 
 
 
165 aa  184  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  55.21 
 
 
166 aa  182  2e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  54.27 
 
 
164 aa  180  8e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  54.6 
 
 
165 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  53.29 
 
 
165 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  52.15 
 
 
168 aa  168  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  50.9 
 
 
199 aa  169  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  48.47 
 
 
175 aa  167  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2756  redoxin domain protein  48.77 
 
 
166 aa  167  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  50.92 
 
 
197 aa  167  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06240  thiol peroxidase  53.01 
 
 
166 aa  167  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  48.78 
 
 
165 aa  167  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.47 
 
 
166 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0349  thiol peroxidase  50.62 
 
 
164 aa  164  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  52.41 
 
 
165 aa  162  2e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  47.13 
 
 
165 aa  160  8e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1604  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  52.17 
 
 
169 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510927  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  48.17 
 
 
166 aa  151  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15610  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.93 
 
 
161 aa  150  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0239273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  48.17 
 
 
166 aa  150  9e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  48.17 
 
 
166 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  48.75 
 
 
172 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  47.56 
 
 
166 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  50.3 
 
 
165 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>