More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1327 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 474 aa  986    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  72.44 
 
 		 470 aa  716    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  60.68 
 
 		 475 aa  623  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  60.68 
 
 		 475 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  62.83 
 
 		 461 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  57.05 
 
 		 470 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  52.9 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl313  beta-glucosidase/alpha xylosidase  51.18 
 
 		 469 aa  495  1e-139  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597092  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl011  beta-glucosidase  50.43 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  45.49 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  47.7 
 
 		 478 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4075  glycoside hydrolase family 1  44.47 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  45.43 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  45.28 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3208  6-phospho-beta-glucosidase BglA  42.56 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.962709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  42.56 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  42.56 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.276018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  42.56 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  42.56 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1705  glycoside hydrolase family 1  45.89 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  43.61 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2741  glycoside hydrolase family 1  44.49 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0749  glycoside hydrolase family 1  43.19 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1668  glycoside hydrolase family 1  44.14 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  41.53 
 
 		 479 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  41.32 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  41.32 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  44.14 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2438  glycoside hydrolase family 1  44.54 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0255622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0771  glycoside hydrolase family 1  44.14 
 
 		 462 aa  364  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.935854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3228  6-phospho-beta-glucosidase BglA  41.12 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1348  glycoside hydrolase family 1  43.09 
 
 		 487 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.843045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  44.65 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  43.09 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3060  6-phospho-beta-glucosidase BglA  41.12 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02733  6-phospho-beta-glucosidase A  40.91 
 
 		 479 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02696  hypothetical protein  40.91 
 
 		 479 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  42.97 
 
 		 479 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  41.79 
 
 		 479 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  41.12 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  42.09 
 
 		 478 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  41.12 
 
 		 479 aa  358  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4246  glycoside hydrolase family 1  42.68 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4273  glycoside hydrolase family protein  42.68 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  43.19 
 
 		 464 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2500  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3320  glycoside hydrolase family protein  41.12 
 
 		 477 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4230  6-phospho-beta-glucosidase  42.98 
 
 		 464 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03605  cryptic phospho-beta-glucosidase B  42.47 
 
 		 464 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3733  glycoside hydrolase family 1  42.09 
 
 		 478 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 		 479 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3935  6-phospho-beta-glucosidase  42.77 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2793  glycoside hydrolase family 1  42.86 
 
 		 473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0271062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1307  glycoside hydrolase family protein  40.34 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3001  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  41.92 
 
 		 474 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  43.46 
 
 		 467 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  41.72 
 
 		 474 aa  350  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3965  glycoside hydrolase family protein  41.25 
 
 		 487 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0889  glycoside hydrolase family 1  42.59 
 
 		 480 aa  349  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  39.55 
 
 		 478 aa  349  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  41.72 
 
 		 474 aa  349  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3967  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  41.51 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1103  6-phospho-beta-glucosidase  41.48 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000818  6-phospho-beta-glucosidase  42.32 
 
 		 463 aa  346  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0996  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  41.1 
 
 		 474 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0301517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0575  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  40.82 
 
 		 476 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  42.41 
 
 		 471 aa  345  8e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0973  glycoside hydrolase family 1  41.1 
 
 		 474 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2852  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  41.1 
 
 		 474 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0011  glycoside hydrolase family 1  38.6 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0012  glycoside hydrolase family 1  38.93 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  39.63 
 
 		 478 aa  343  4e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0185  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  41.34 
 
 		 496 aa  342  8e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000347604  hitchhiker  0.00387129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  39.54 
 
 		 478 aa  342  8e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1821  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  40.82 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0764  glycoside hydrolase family 1  39.51 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3189  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  40.78 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06724  phospho-beta-glucosidase B  41.98 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1584  glycoside hydrolase family 1  39.29 
 
 		 451 aa  339  5e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  38.91 
 
 		 496 aa  339  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3901  glycoside hydrolase family 1  40.53 
 
 		 479 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00796853  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0341  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  39.75 
 
 		 485 aa  339  5.9999999999999996e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02566  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  40.29 
 
 		 474 aa  339  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02531  hypothetical protein  40.29 
 
 		 474 aa  339  7e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0767  glycoside hydrolase family 1  40.79 
 
 		 475 aa  338  9e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1544  beta-glucosidase  39.55 
 
 		 478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2140  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  40.74 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0902  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  40.9 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3467  glycoside hydrolase family 1  40 
 
 		 475 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1735  6-phospho-beta-glucosidase  40.08 
 
 		 479 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1615  6-phospho-beta-glucosidase  40.08 
 
 		 479 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  41.79 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0968  glycoside hydrolase family 1  38.4 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0224  6-phospho-beta-glucosidase  39.05 
 
 		 480 aa  333  3e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1637  6-phospho-beta-glucosidase  39.88 
 
 		 479 aa  333  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2729  6-phospho-beta-glucosidase BglA  39.23 
 
 		 478 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.36988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2481  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  40.33 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2805  glycoside hydrolase family protein  39.63 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1478  6-phospho-beta-glucosidase  39.63 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1210  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  38.93 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>