More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_16531 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_16531  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0329531  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16651  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1556  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.995978  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  185  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16421  nitrogen regulatory protein P-II  94.64 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  175  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  173  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04671  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 114 aa  147  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  62.5 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  62.5 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  61.61 
 
 		 114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  58.04 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  58.04 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>