31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0052 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0052  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 
235 aa  450  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0047  hypothetical protein  63.59 
 
 
195 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  35.76 
 
 
198 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  36.42 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  35.8 
 
 
193 aa  85.1  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  35.45 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  35.51 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  35.85 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  41.79 
 
 
214 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  36.49 
 
 
170 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  39.29 
 
 
167 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  32.48 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  31.58 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.5 
 
 
474 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  32.26 
 
 
589 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  46.43 
 
 
598 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  46.43 
 
 
582 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  46.43 
 
 
577 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  46.43 
 
 
582 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  31.06 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  46.43 
 
 
579 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  46.43 
 
 
341 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  46.43 
 
 
582 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.43 
 
 
580 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.65 
 
 
553 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  39.44 
 
 
575 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  29.46 
 
 
184 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  44.64 
 
 
578 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.27 
 
 
907 aa  42  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.9 
 
 
657 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>