299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4135 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  100 
 
 
155 aa  312  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  57.72 
 
 
151 aa  181  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  54.67 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  56.08 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  57.75 
 
 
152 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  55.7 
 
 
162 aa  167  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  53.69 
 
 
151 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  56.46 
 
 
150 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  56.29 
 
 
150 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  57.93 
 
 
153 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  58.09 
 
 
153 aa  164  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  52 
 
 
194 aa  162  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  50.67 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  51.33 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  51.33 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2169  dehydratase  52.45 
 
 
161 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  55.24 
 
 
151 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  52.63 
 
 
156 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  51.7 
 
 
155 aa  158  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  52.98 
 
 
158 aa  157  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  50.67 
 
 
151 aa  156  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  51.02 
 
 
156 aa  156  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  55.03 
 
 
150 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  55.03 
 
 
150 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  55.03 
 
 
150 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  53.42 
 
 
150 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  51.33 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  48 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  54.61 
 
 
151 aa  154  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  54.36 
 
 
150 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  53.9 
 
 
150 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  56.46 
 
 
151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  46.67 
 
 
151 aa  151  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  53.42 
 
 
168 aa  150  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  52.82 
 
 
151 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3764  dehydratase  49.01 
 
 
152 aa  148  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.51064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0126  enoyl-CoA hydratase  54.42 
 
 
152 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.787557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  50.7 
 
 
151 aa  147  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  147  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4012  Enoyl-CoA hydratase  52.03 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4410  dehydratase  48.92 
 
 
157 aa  144  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  51.05 
 
 
153 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1606  MaoC domain protein dehydratase  53.9 
 
 
153 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00168031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  44.87 
 
 
157 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  48.34 
 
 
150 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  47.55 
 
 
158 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4112  Enoyl-CoA hydratase  50.36 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0069293  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  51.35 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  45.64 
 
 
158 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  44.3 
 
 
159 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  44.94 
 
 
159 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  47.3 
 
 
151 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  46.71 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  44.1 
 
 
162 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  45.03 
 
 
151 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  48.65 
 
 
151 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0292  Enoyl-CoA hydratase  49.26 
 
 
162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000103389  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  50 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  50 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  48.65 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  50 
 
 
160 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  50 
 
 
160 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  50 
 
 
160 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  48.28 
 
 
151 aa  133  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  50 
 
 
160 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  50 
 
 
160 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  50 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  46.62 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  50 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  47.22 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  54.48 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  50.36 
 
 
151 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  49.35 
 
 
160 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  48.57 
 
 
151 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  46.9 
 
 
151 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  41.77 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0497  hypothetical protein  44.97 
 
 
226 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.628892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  44.14 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  45.14 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4259  MaoC domain protein dehydratase  48.89 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358063  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  45.14 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  46.1 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  46.67 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  44.81 
 
 
158 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  44.81 
 
 
158 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  44.81 
 
 
158 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2724  Enoyl-CoA hydratase  45.75 
 
 
160 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0179226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3089  MaoC-like dehydratase  42.95 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.767095  normal  0.110769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1034  dehydratase  46 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248212  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3583  nodN-like protein  43.26 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.234832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  47.55 
 
 
158 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5557  MaoC-like dehydratase  44.81 
 
 
158 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  44.81 
 
 
158 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  45.21 
 
 
161 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  44.16 
 
 
158 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  46.43 
 
 
152 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1690  MaoC-like dehydratase  44.03 
 
 
148 aa  120  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  43.66 
 
 
155 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2906  MaoC domain-containing protein dehydratase  53.33 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  46.15 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>