More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3073 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3073  ATPase  100 
 
 
324 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.79 
 
 
356 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  66.77 
 
 
359 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  66.67 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.77 
 
 
354 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  65.3 
 
 
350 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.78 
 
 
341 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  67.11 
 
 
350 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.05 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  68.77 
 
 
342 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  65.71 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.66 
 
 
337 aa  394  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  66.23 
 
 
342 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  67.74 
 
 
328 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.61 
 
 
332 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  65.58 
 
 
332 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.26 
 
 
351 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.26 
 
 
339 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  58.18 
 
 
372 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.76 
 
 
326 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1280  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.06 
 
 
383 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000592788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.69 
 
 
325 aa  345  8e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  57.33 
 
 
323 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  53.77 
 
 
347 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  52.81 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  52.23 
 
 
327 aa  335  9e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  52.24 
 
 
331 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  52.72 
 
 
317 aa  328  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  56.71 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.84 
 
 
321 aa  325  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  51.92 
 
 
331 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.97 
 
 
319 aa  322  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.49 
 
 
309 aa  318  6e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.64 
 
 
322 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.27 
 
 
314 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
315 aa  316  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  46.71 
 
 
318 aa  316  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  48.53 
 
 
309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.99 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  55.15 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2420  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.81 
 
 
325 aa  310  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
313 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  47.39 
 
 
312 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.54 
 
 
318 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  55.09 
 
 
316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.48 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  48.54 
 
 
318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  48.06 
 
 
320 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.67 
 
 
319 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  48.06 
 
 
320 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  54.87 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  49.49 
 
 
313 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.83 
 
 
306 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.83 
 
 
306 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.98 
 
 
302 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  55.37 
 
 
352 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.46 
 
 
325 aa  299  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.17 
 
 
319 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.88 
 
 
312 aa  299  5e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  50.84 
 
 
302 aa  298  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  49.5 
 
 
305 aa  298  9e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  49.17 
 
 
305 aa  298  9e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  50.84 
 
 
316 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
324 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
321 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3212  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.97 
 
 
322 aa  293  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0307569  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  50.83 
 
 
331 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 
313 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  49.65 
 
 
320 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  48 
 
 
310 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.65 
 
 
320 aa  292  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.29 
 
 
320 aa  292  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16660  MoxR-like ATPase  55.18 
 
 
318 aa  291  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.54 
 
 
324 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  49.21 
 
 
319 aa  291  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.94 
 
 
320 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
333 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.07 
 
 
314 aa  289  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.32 
 
 
330 aa  289  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  48.59 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  46.69 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.94 
 
 
320 aa  289  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.5 
 
 
318 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.45 
 
 
325 aa  288  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  49.17 
 
 
323 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  49.09 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.37 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
343 aa  285  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.21 
 
 
323 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  46.77 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  49.64 
 
 
310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0485  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.53 
 
 
327 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.176782  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2537  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.06 
 
 
320 aa  282  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  48.15 
 
 
457 aa  281  8.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  44.73 
 
 
340 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.03 
 
 
326 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  45.6 
 
 
322 aa  279  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  44.85 
 
 
308 aa  278  9e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2110  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.72 
 
 
400 aa  276  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.625563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>