More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1478 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1478  ATPase  100 
 
 		 340 aa  671    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  67.64 
 
 		 332 aa  418  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  66.45 
 
 		 325 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  67.61 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0902  ATPase  67.3 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1589  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.58 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0629676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.27 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.9 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.29 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  62.5 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.01 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  61.79 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  61.39 
 
 		 320 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  61.39 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.49 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  61.39 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.8 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  60.8 
 
 		 317 aa  359  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.97 
 
 		 310 aa  357  9.999999999999999e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  60.8 
 
 		 320 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  57.78 
 
 		 318 aa  349  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  56.87 
 
 		 318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  54.05 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.82 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  53.99 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  53.87 
 
 		 347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.44 
 
 		 319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.96 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  51.59 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  46.28 
 
 		 318 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.36 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.26 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.15 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 		 327 aa  308  6.999999999999999e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  47.19 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  46.86 
 
 		 320 aa  308  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1283  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.94 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000785499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0910  ATPase  49.37 
 
 		 314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.64 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.64 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  48.3 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  55.15 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  55.15 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  55.15 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  51.66 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.3 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.3 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1882  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.41 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2037  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.27 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  50.84 
 
 		 305 aa  299  4e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  52.12 
 
 		 353 aa  298  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  49.67 
 
 		 313 aa  298  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.39 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  50.17 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.7 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 		 313 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.54 
 
 		 318 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.32 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.73 
 
 		 313 aa  295  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  50 
 
 		 317 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  49.26 
 
 		 347 aa  295  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.88 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  51.08 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.97 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  53 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  45.48 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  49.47 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  52.49 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1693  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.2 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  50.16 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  44.88 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.99 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.15 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 403 aa  290  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0585  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.44335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  54.46 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  46.38 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.96 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  47.96 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  45.99 
 
 		 349 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.85 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  50.66 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.36 
 
 		 317 aa  289  6e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  42.04 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.36 
 
 		 326 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.65 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.02 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.69 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.04 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.82 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  52.32 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  52.4 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  43.63 
 
 		 318 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  46.6 
 
 		 296 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  46.6 
 
 		 296 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  50.99 
 
 		 302 aa  285  8e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  53.82 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  49.54 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  48.33 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>