More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1266 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1266  acetolactate synthase large subunit  100 
 
 
602 aa  1244    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2560  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.02 
 
 
573 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000271615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0189  acetolactate synthase large subunit  42.81 
 
 
580 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.9 
 
 
562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0410  acetolactate synthase large subunit  30.5 
 
 
550 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000680681  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.71 
 
 
569 aa  221  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  29.97 
 
 
569 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.18 
 
 
579 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.95 
 
 
582 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.07 
 
 
548 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.9 
 
 
548 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.07 
 
 
548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.9 
 
 
548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.9 
 
 
548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.31 
 
 
554 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  28.38 
 
 
562 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  28.38 
 
 
562 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  28.38 
 
 
562 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  28.38 
 
 
562 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2488  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.3 
 
 
548 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.818345  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  28.21 
 
 
562 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.76 
 
 
548 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.38 
 
 
548 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.05 
 
 
548 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00410  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.6 
 
 
548 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.16 
 
 
568 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  29.05 
 
 
562 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  28.93 
 
 
562 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  27.92 
 
 
562 aa  208  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.92 
 
 
562 aa  208  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  27.92 
 
 
562 aa  208  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.34 
 
 
563 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  30.28 
 
 
568 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  27.92 
 
 
562 aa  208  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  27.92 
 
 
562 aa  208  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  28.93 
 
 
562 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  28.93 
 
 
562 aa  207  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.09 
 
 
566 aa  207  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.65 
 
 
548 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13507  acetolactate synthase large subunit ilvB2  29.45 
 
 
552 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  28.88 
 
 
562 aa  206  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.45 
 
 
556 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.45 
 
 
561 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.98 
 
 
568 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.86 
 
 
581 aa  205  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.93 
 
 
553 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.18 
 
 
548 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.22 
 
 
548 aa  204  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  28.62 
 
 
562 aa  204  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.21 
 
 
557 aa  204  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.29 
 
 
555 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  29.22 
 
 
548 aa  203  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  27.57 
 
 
587 aa  203  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.22 
 
 
548 aa  203  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  29.22 
 
 
548 aa  203  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.69 
 
 
581 aa  203  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.02 
 
 
582 aa  203  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.22 
 
 
548 aa  203  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.24 
 
 
555 aa  203  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  28.41 
 
 
599 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.89 
 
 
548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.74 
 
 
572 aa  202  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.89 
 
 
548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.05 
 
 
548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  28.94 
 
 
583 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.2 
 
 
548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.16 
 
 
555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.91 
 
 
636 aa  201  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.76 
 
 
568 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  26.53 
 
 
572 aa  200  5e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  26.71 
 
 
566 aa  200  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.06 
 
 
569 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  27.71 
 
 
575 aa  199  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.43 
 
 
593 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.65 
 
 
565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.59 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.1 
 
 
593 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.79 
 
 
552 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.68 
 
 
563 aa  198  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.21 
 
 
563 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2652  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.09 
 
 
586 aa  197  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  28.01 
 
 
587 aa  197  7e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.61 
 
 
557 aa  196  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.46 
 
 
632 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.93 
 
 
562 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.92 
 
 
591 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  27.23 
 
 
591 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.57 
 
 
570 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.83 
 
 
567 aa  196  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.37 
 
 
573 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 
591 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  27.15 
 
 
576 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  27.33 
 
 
587 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.79 
 
 
535 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.82 
 
 
609 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.78 
 
 
559 aa  194  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.67 
 
 
619 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.4 
 
 
602 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  29.12 
 
 
547 aa  193  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.93 
 
 
584 aa  193  7e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>