46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0291 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  648    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  47.4 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  27.48 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31050  hypothetical protein  40.59 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019921  unclonable  2.92536e-22 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  29.08 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  32.09 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4390  peptidase M56 BlaR1  32.57 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431329  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  28.31 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0968  peptidase M48 Ste24p  36.48 
 
 
296 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  36.28 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  35.45 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  34.55 
 
 
330 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4312  peptidase M56 BlaR1  33.96 
 
 
349 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  25.49 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  26.09 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  29.58 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  30.09 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  30.11 
 
 
314 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2852  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  21.51 
 
 
270 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  21.17 
 
 
270 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  26.98 
 
 
307 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  24.68 
 
 
270 aa  46.2  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  24.68 
 
 
270 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  24.68 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  24.68 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  24.38 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  24.68 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4986  peptidase M48 Ste24p  29.21 
 
 
396 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  23.75 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  29.75 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  29.75 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  29.75 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  28.77 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  25.94 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  29.17 
 
 
316 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  32.67 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 
317 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  25.21 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  25.21 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>