275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3243 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  89.52 
 
 		 210 aa  397  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  76.19 
 
 		 210 aa  342  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  75.24 
 
 		 210 aa  340  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  76.67 
 
 		 210 aa  333  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  73.81 
 
 		 210 aa  327  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  76.67 
 
 		 210 aa  323  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  66.67 
 
 		 211 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  68.57 
 
 		 210 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  67.45 
 
 		 212 aa  297  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  66.98 
 
 		 212 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  68.69 
 
 		 212 aa  295  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  66.82 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  69.05 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  66.35 
 
 		 211 aa  291  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  65.07 
 
 		 210 aa  290  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  67.62 
 
 		 211 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  64.9 
 
 		 210 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  68.25 
 
 		 212 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  68.25 
 
 		 212 aa  287  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  64.59 
 
 		 210 aa  287  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  65.07 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  64.11 
 
 		 210 aa  285  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  65.07 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  64.59 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  65.07 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  65.07 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  67.62 
 
 		 211 aa  284  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  68.9 
 
 		 210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  64.59 
 
 		 210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  64.59 
 
 		 210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  64.59 
 
 		 210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  64.42 
 
 		 209 aa  279  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  65.57 
 
 		 212 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  68.42 
 
 		 210 aa  279  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  63.16 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  63.51 
 
 		 211 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  63.68 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  63.98 
 
 		 211 aa  274  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  62.2 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  62.2 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  62.2 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  62.2 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  62.2 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  62.38 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  62.2 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  62.2 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  64.06 
 
 		 212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  64.73 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  62.62 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  67.94 
 
 		 210 aa  272  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  61.32 
 
 		 212 aa  271  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  60.17 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  64.59 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  57.87 
 
 		 217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  59.52 
 
 		 211 aa  267  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  63.94 
 
 		 210 aa  265  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  61.03 
 
 		 215 aa  260  8e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  54.38 
 
 		 218 aa  255  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  62.68 
 
 		 209 aa  250  9.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  56.48 
 
 		 218 aa  249  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  53.27 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  65.55 
 
 		 210 aa  244  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  57.21 
 
 		 216 aa  234  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  62.79 
 
 		 222 aa  234  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  57.87 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  54.91 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  46.44 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  40.18 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  35.19 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  34.08 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  34.36 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  34.43 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  34.26 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  36.53 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  34.44 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  32.63 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  31.95 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  31.95 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  34.25 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  31.06 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  29.91 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  30.61 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  30.77 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  30.77 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  28.45 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  30.77 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  31.36 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  31.88 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  30.22 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  30.22 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  28.18 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  30.29 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  31.48 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>