228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3562 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  73.62 
 
 		 490 aa  725    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  95.93 
 
 		 493 aa  976    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05120  (4Fe-4S) cluster-containing protein  67.92 
 
 		 545 aa  719    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  64.67 
 
 		 528 aa  657    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  69.53 
 
 		 510 aa  720    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4386  Iron-sulfur cluster binding protein  72.51 
 
 		 484 aa  714    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.707954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  91.26 
 
 		 494 aa  934    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 501 aa  1033    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4473  iron-sulfur cluster binding protein  72.51 
 
 		 484 aa  714    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.905918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4767  iron-sulfur cluster binding protein  72.51 
 
 		 484 aa  714    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  95.93 
 
 		 493 aa  975    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  66.33 
 
 		 512 aa  633  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  65.75 
 
 		 485 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  66.95 
 
 		 478 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  64.82 
 
 		 475 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  63.51 
 
 		 493 aa  610  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  63.2 
 
 		 479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  64.11 
 
 		 486 aa  601  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  62.14 
 
 		 496 aa  594  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  62.32 
 
 		 481 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12940  (4Fe-4S) cluster-containing protein  61.66 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  63.52 
 
 		 467 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  59.84 
 
 		 475 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  58.99 
 
 		 470 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  61.78 
 
 		 479 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  60.89 
 
 		 498 aa  551  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2424  protein of unknown function DUF162  48.41 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00298547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  45.69 
 
 		 472 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  41.72 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  41.93 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  41.72 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  41.72 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  40.5 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  40.94 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  43.46 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  42.22 
 
 		 480 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  40.46 
 
 		 475 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  37.8 
 
 		 475 aa  359  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  39.45 
 
 		 473 aa  359  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  37.92 
 
 		 475 aa  359  8e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  37.92 
 
 		 475 aa  359  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  37.92 
 
 		 475 aa  359  8e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  43.44 
 
 		 489 aa  358  9e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  37.92 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  37.92 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  39.92 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  40.2 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  43.18 
 
 		 458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  37.92 
 
 		 475 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  37.92 
 
 		 475 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  42.33 
 
 		 482 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  37.72 
 
 		 475 aa  355  8.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  43.47 
 
 		 475 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  43.19 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  41.86 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  40.47 
 
 		 474 aa  353  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 		 477 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 		 477 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  46.23 
 
 		 480 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  46.31 
 
 		 479 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  45.92 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  41.92 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  39.45 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  42.41 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  42.41 
 
 		 477 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  41.44 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  40.64 
 
 		 478 aa  348  9e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  41.27 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  40.93 
 
 		 484 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  45.36 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  42.19 
 
 		 457 aa  346  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.72 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  45.11 
 
 		 481 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  40 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  38.39 
 
 		 473 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  38.61 
 
 		 473 aa  342  8e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  38.61 
 
 		 473 aa  342  8e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  38.39 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  38.85 
 
 		 492 aa  342  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  38.39 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  38.39 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  38.39 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  38.39 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 		 472 aa  342  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  44.85 
 
 		 481 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  38.39 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  38.39 
 
 		 473 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  43.95 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  44.76 
 
 		 481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  44.59 
 
 		 481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  38.18 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  42.67 
 
 		 480 aa  339  7e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  44.94 
 
 		 482 aa  339  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  44.59 
 
 		 481 aa  339  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  40.86 
 
 		 459 aa  338  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 		 484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  41.56 
 
 		 476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  40.76 
 
 		 475 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  41.89 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>