More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0057 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03223  6-phosphofructo-1-kinase (phosphofructokinase) (Eurofung)  44.73 
 
 		 795 aa  650    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2702  6-phosphofructokinase  55.83 
 
 		 747 aa  830    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0057  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 748 aa  1524    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2734  6-phosphofructokinase  60.08 
 
 		 741 aa  917    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1875  6-phosphofructokinase  60.35 
 
 		 744 aa  920    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.507324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66973  6-phosphofructokinase beta subunit (Phosphofructokinase 2) (Phosphohexokinase) (6PF-1-K beta subunit) (CaPFK2)  43.87 
 
 		 946 aa  613  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.33779 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70563  6-phosphofructokinase, alpha subunit  42.2 
 
 		 978 aa  599  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.973256  normal  0.501481 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01080  6-phosphofructokinase, putative  43.64 
 
 		 914 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  43.89 
 
 		 331 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  41.98 
 
 		 319 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  40.35 
 
 		 319 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  42.29 
 
 		 323 aa  244  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  38.78 
 
 		 326 aa  242  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  40.52 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  39.61 
 
 		 319 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  42.7 
 
 		 322 aa  240  6.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  41.35 
 
 		 328 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  39.33 
 
 		 319 aa  238  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  42.06 
 
 		 319 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  41.72 
 
 		 320 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  41.72 
 
 		 320 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  40.59 
 
 		 331 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  41.01 
 
 		 322 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  38.78 
 
 		 326 aa  234  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  40.75 
 
 		 326 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  41.18 
 
 		 335 aa  233  7.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  38.95 
 
 		 335 aa  233  8.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  40.88 
 
 		 319 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  40.36 
 
 		 320 aa  233  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  42.28 
 
 		 320 aa  233  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 319 aa  233  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 319 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 319 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 319 aa  232  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 319 aa  232  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 319 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  42.28 
 
 		 320 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 		 320 aa  232  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 319 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 319 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  40.76 
 
 		 319 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4126  6-phosphofructokinase  41.23 
 
 		 327 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0088  6-phosphofructokinase  41.23 
 
 		 327 aa  231  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0089  6-phosphofructokinase  41.23 
 
 		 327 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  41.06 
 
 		 319 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  40.52 
 
 		 319 aa  231  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  40.52 
 
 		 319 aa  231  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  38.53 
 
 		 319 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  38.11 
 
 		 328 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  40.59 
 
 		 320 aa  228  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  38.55 
 
 		 321 aa  228  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  42.07 
 
 		 319 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  42.07 
 
 		 319 aa  228  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  39.77 
 
 		 322 aa  227  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  38.24 
 
 		 320 aa  227  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 322 aa  227  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  37.4 
 
 		 332 aa  226  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  38.33 
 
 		 328 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  225  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  43.51 
 
 		 319 aa  224  6e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 		 320 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 		 320 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 		 320 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 		 320 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 		 320 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 		 320 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 		 321 aa  221  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  39.88 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  39.76 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 320 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2448  6-phosphofructokinase  42.73 
 
 		 319 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  39.09 
 
 		 336 aa  221  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  41.45 
 
 		 339 aa  221  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  40.28 
 
 		 347 aa  220  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  40.19 
 
 		 323 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  39.17 
 
 		 320 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0171  6-phosphofructokinase  41.44 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  40.54 
 
 		 319 aa  219  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  38.03 
 
 		 320 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  39.77 
 
 		 328 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  40.99 
 
 		 324 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  40.82 
 
 		 350 aa  217  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1769  6-phosphofructokinase  42.73 
 
 		 319 aa  216  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011293 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0549  6-phosphofructokinase  38.91 
 
 		 319 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 324 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  40.69 
 
 		 344 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  39.82 
 
 		 324 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  38.35 
 
 		 322 aa  213  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  38.35 
 
 		 322 aa  213  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  36.07 
 
 		 324 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  40.88 
 
 		 329 aa  211  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 		 340 aa  210  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>