More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0549 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0549  6-phosphofructokinase  100 
 
 
319 aa  651    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0210  6-phosphofructokinase  47.5 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  41.67 
 
 
319 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  41.67 
 
 
319 aa  258  7e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  47.12 
 
 
319 aa  252  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  41.74 
 
 
331 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  40.58 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  42.37 
 
 
322 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  43.05 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  44.96 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  43.05 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  39.63 
 
 
332 aa  242  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  39.81 
 
 
319 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  41.35 
 
 
319 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  46.26 
 
 
328 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  41.99 
 
 
326 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  40.71 
 
 
319 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  40.71 
 
 
319 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4126  6-phosphofructokinase  43 
 
 
327 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
320 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
320 aa  238  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
320 aa  238  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0088  6-phosphofructokinase  43 
 
 
327 aa  238  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
320 aa  238  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
320 aa  238  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  41.25 
 
 
320 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
320 aa  238  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
320 aa  238  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0089  6-phosphofructokinase  43 
 
 
327 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  41.25 
 
 
320 aa  238  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  39.1 
 
 
322 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  38.98 
 
 
319 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  45.91 
 
 
326 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  38.02 
 
 
335 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  40.94 
 
 
320 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  40.94 
 
 
320 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  40.94 
 
 
320 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  40.94 
 
 
320 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  38.98 
 
 
321 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  40.94 
 
 
320 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  38.8 
 
 
320 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  39.62 
 
 
319 aa  236  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  40.62 
 
 
320 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1738  6-phosphofructokinase  40.45 
 
 
332 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0448  6-phosphofructokinase  40.45 
 
 
332 aa  235  9e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.76635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  39.81 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  40.76 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  39.56 
 
 
323 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  40.58 
 
 
331 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  40.58 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  41.21 
 
 
321 aa  232  5e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  39.38 
 
 
324 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  38.83 
 
 
320 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  44.48 
 
 
324 aa  229  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  39.18 
 
 
319 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  39.56 
 
 
319 aa  229  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  40.89 
 
 
320 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 
324 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  40.31 
 
 
320 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  39.75 
 
 
320 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  41.03 
 
 
319 aa  229  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  38.12 
 
 
320 aa  228  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  40.58 
 
 
319 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  38.12 
 
 
320 aa  228  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  38.8 
 
 
322 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  40 
 
 
324 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  39.69 
 
 
328 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  38.44 
 
 
321 aa  225  8e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  41.18 
 
 
320 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  38.12 
 
 
320 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2448  6-phosphofructokinase  44.96 
 
 
319 aa  225  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  39.94 
 
 
319 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  39.23 
 
 
320 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  39.42 
 
 
320 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  40.21 
 
 
323 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  37.5 
 
 
320 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 
327 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1769  6-phosphofructokinase  44.24 
 
 
319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011293 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0171  6-phosphofructokinase  37.81 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  38.24 
 
 
326 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  39.87 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2041  6-phosphofructokinase  44.73 
 
 
318 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  39.1 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  38.67 
 
 
320 aa  219  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  37.62 
 
 
324 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2702  6-phosphofructokinase  38.71 
 
 
747 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0057  6-phosphofructokinase  38.91 
 
 
748 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  38.56 
 
 
347 aa  216  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  38.51 
 
 
322 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  40.86 
 
 
322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  38.24 
 
 
339 aa  215  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>