34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0009 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0009  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  207  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0008  hypothetical protein  56.07 
 
 
288 aa  128  2e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00080  hypothetical protein  55.14 
 
 
248 aa  117  5e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.852308  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0011  hypothetical protein  55.24 
 
 
232 aa  113  1e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0820  hypothetical protein  50.93 
 
 
314 aa  109  1e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12406  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0008  hypothetical protein  50.93 
 
 
301 aa  109  1e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0012  hypothetical protein  54.72 
 
 
237 aa  109  2e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0016  hypothetical protein  49.07 
 
 
290 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403515  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0008  hypothetical protein  49.07 
 
 
290 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0746422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0008  hypothetical protein  49.07 
 
 
290 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10007  hypothetical protein  45.79 
 
 
304 aa  100  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0007  hypothetical protein  43.81 
 
 
316 aa  93.6  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0008  hypothetical protein  41.67 
 
 
245 aa  81.3  5e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0008  hypothetical protein  35.58 
 
 
645 aa  76.3  1e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0010  hypothetical protein  47.31 
 
 
308 aa  73.6  9e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.455486  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0009  hypothetical protein  48.35 
 
 
302 aa  73.6  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0008  hypothetical protein  38.32 
 
 
202 aa  73.2  1e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.252458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0008  hypothetical protein  34.51 
 
 
252 aa  70.9  5e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0009  hypothetical protein  34.58 
 
 
228 aa  70.5  8e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0007  hypothetical protein  39.42 
 
 
152 aa  69.7  1e-11  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0008  hypothetical protein  32.73 
 
 
230 aa  66.6  1e-10  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.327365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0008  hypothetical protein  40.7 
 
 
172 aa  66.2  1e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  65.5  2e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.576466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0009  hypothetical protein  39.25 
 
 
215 aa  62.8  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994144  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0008  hypothetical protein  41.28 
 
 
274 aa  58.2  4e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00070  hypothetical protein  29.63 
 
 
166 aa  49.7  1e-05  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0008  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  49.3  2e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00852528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1430  hypothetical protein  33.96 
 
 
188 aa  48.5  3e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0008  putative FHA domain containing protein  29.36 
 
 
331 aa  47.8  5e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0008  hypothetical protein  27.62 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00080  hypothetical protein  30.1 
 
 
275 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00080  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0008  hypothetical protein  54.29 
 
 
305 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0008  putative integral membrane protein  25.23 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.31576e-15 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>