More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0544 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0544  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
246 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  3.53659e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.23 
 
 
258 aa  255  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  54.01 
 
 
247 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.73 
 
 
244 aa  247  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.25 
 
 
231 aa  245  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  52.81 
 
 
252 aa  239  3e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.75 
 
 
245 aa  238  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.92 
 
 
248 aa  230  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  49.35 
 
 
236 aa  227  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.38 
 
 
256 aa  222  5e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.53 
 
 
270 aa  221  1e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.10136e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.9 
 
 
270 aa  213  3e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.9 
 
 
270 aa  211  8e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.9 
 
 
266 aa  209  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.23 
 
 
258 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  43.09 
 
 
264 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  42.68 
 
 
269 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  43.32 
 
 
248 aa  200  1e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.93391e-11  hitchhiker  5.36113e-07 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.4 
 
 
237 aa  199  4e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.39 
 
 
269 aa  198  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.4844e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.38 
 
 
239 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.76 
 
 
386 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 
270 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  42.86 
 
 
269 aa  192  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.57 
 
 
244 aa  190  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.12 
 
 
383 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.38 
 
 
379 aa  189  3e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.62 
 
 
386 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0654  thiF family protein  40.65 
 
 
248 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.72 
 
 
383 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  41.37 
 
 
377 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.9 
 
 
266 aa  185  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0357  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.8 
 
 
239 aa  185  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.120454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.93 
 
 
243 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.9 
 
 
393 aa  184  1e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  3.25534e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.28 
 
 
389 aa  183  2e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.36 
 
 
271 aa  182  4e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1567  thiamine biosynthesis protein ThiF  42.15 
 
 
247 aa  182  5e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0683473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.6 
 
 
278 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0645  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.84 
 
 
268 aa  181  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0480  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.8 
 
 
239 aa  181  8e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.116594  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0130  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.25 
 
 
257 aa  181  9e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.67 
 
 
393 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2539  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.08 
 
 
270 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.214496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.28 
 
 
377 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.08 
 
 
393 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.25 
 
 
348 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.2 
 
 
390 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.95 
 
 
268 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  41.2 
 
 
390 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.4 
 
 
255 aa  179  3e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.92 
 
 
247 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.06 
 
 
280 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  43.09 
 
 
349 aa  179  5e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.8 
 
 
387 aa  179  5e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.08 
 
 
364 aa  178  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1231  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.42 
 
 
262 aa  178  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.73 
 
 
272 aa  178  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.56 
 
 
249 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.4 
 
 
390 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.87 
 
 
259 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.45 
 
 
270 aa  176  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.45 
 
 
392 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.32 
 
 
383 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.04 
 
 
392 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
250 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.68 
 
 
348 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.97 
 
 
396 aa  175  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.32 
 
 
254 aa  175  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.13 
 
 
284 aa  175  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  8.53267e-08  normal  0.0112488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  44.08 
 
 
389 aa  174  1e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  41.22 
 
 
377 aa  174  1e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4109  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.08 
 
 
269 aa  174  1e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.84 
 
 
399 aa  174  1e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24873e-07 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.55 
 
 
254 aa  173  2e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  42.04 
 
 
393 aa  173  2e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.27 
 
 
390 aa  173  2e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.31 
 
 
480 aa  172  3e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.29 
 
 
375 aa  173  3e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.22 
 
 
273 aa  172  4e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.37 
 
 
266 aa  172  4e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.84 
 
 
399 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0909  UBA/THIF-type NAD/FAD binding  42.91 
 
 
350 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  42.08 
 
 
388 aa  172  6e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.86 
 
 
390 aa  172  6e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.6 
 
 
263 aa  171  8e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.76 
 
 
252 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0462  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.62 
 
 
358 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.987597  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  40.32 
 
 
257 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.42 
 
 
241 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.2 
 
 
254 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.96 
 
 
250 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.32 
 
 
350 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.36 
 
 
250 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.43 
 
 
287 aa  169  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.96 
 
 
250 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.49 
 
 
247 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.22 
 
 
392 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.36 
 
 
266 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1261  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.75 
 
 
246 aa  169  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>