28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0055 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  44.5 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  33.89 
 
 		 261 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31.11 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.43 
 
 		 279 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.03 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.2 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.11 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.33 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.74 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  25.63 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.24 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.37 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.31 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.33 
 
 		 300 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1249  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.37 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.65 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.44 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.44 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.44 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.76 
 
 		 368 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  20.5 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  23.12 
 
 		 343 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4011  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  34.48 
 
 		 441 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.923293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>