28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0055 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 
205 aa  418  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  44.5 
 
 
219 aa  184  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  33.89 
 
 
261 aa  118  5e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  31.11 
 
 
207 aa  104  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.43 
 
 
279 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  29.17 
 
 
259 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.03 
 
 
211 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.2 
 
 
258 aa  84  1e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25 
 
 
250 aa  79.7  3e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.11 
 
 
249 aa  72.8  4e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.33 
 
 
254 aa  63.5  2e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.74 
 
 
257 aa  61.2  1e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 
259 aa  57.4  1e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  25.63 
 
 
260 aa  57.8  1e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.24 
 
 
270 aa  56.6  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.37 
 
 
268 aa  55.5  6e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.31 
 
 
324 aa  50.8  2e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.33 
 
 
300 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.37 
 
 
249 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1249  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20 
 
 
251 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4132  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.65 
 
 
248 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.44 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.44 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.44 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.76 
 
 
368 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  20.5 
 
 
262 aa  42.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  23.12 
 
 
343 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4011  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  34.48 
 
 
441 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.923293  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>