17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0060 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  803    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.839104 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1324  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  36.84 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.799769  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2736  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.91 
 
 		 748 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.45 
 
 		 739 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3301  hypothetical protein  32.32 
 
 		 751 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793369  normal  0.543821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2177  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.44 
 
 		 755 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.469319  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1350  hypothetical protein  30.82 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 861 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1557  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.79 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814898 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3568  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.1 
 
 		 550 aa  57  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0869  histidine kinase  22.78 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1652  diguanylate cyclase  27.53 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.749875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1586  diguanylate cyclase  27.17 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 		 868 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 2153 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 718 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>