More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4844 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  83.72 
 
 
457 aa  752    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  69.27 
 
 
441 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  68.18 
 
 
441 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  68.25 
 
 
443 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  100 
 
 
448 aa  908    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  83.26 
 
 
444 aa  749    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  83.49 
 
 
444 aa  751    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  64.64 
 
 
448 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  70.07 
 
 
461 aa  626  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  68.18 
 
 
444 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  66.36 
 
 
445 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  65.45 
 
 
445 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  65.5 
 
 
1121 aa  597  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  63.72 
 
 
448 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  63.72 
 
 
448 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  64.22 
 
 
439 aa  589  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  58.22 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.22 
 
 
457 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  55.15 
 
 
457 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  56.72 
 
 
439 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  54.77 
 
 
458 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  53.81 
 
 
458 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  57.05 
 
 
445 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  56.59 
 
 
445 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  55.76 
 
 
453 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  56.16 
 
 
441 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  55.33 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  56.98 
 
 
450 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  56.04 
 
 
442 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  55.48 
 
 
454 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.22 
 
 
457 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  53.08 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.81 
 
 
460 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  50.9 
 
 
454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.61 
 
 
452 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.35 
 
 
446 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  52.94 
 
 
434 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  51.11 
 
 
458 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  49.77 
 
 
456 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.18 
 
 
449 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  52.14 
 
 
451 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  51.36 
 
 
457 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  51.61 
 
 
448 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  51.36 
 
 
448 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  50.79 
 
 
455 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  51.93 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.17 
 
 
440 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.42 
 
 
441 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  49.89 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  49.34 
 
 
451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  49.33 
 
 
452 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  52.27 
 
 
449 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  48.39 
 
 
429 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  49.32 
 
 
450 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  49.32 
 
 
450 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  49.43 
 
 
439 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  48.31 
 
 
448 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  50.34 
 
 
442 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  46.64 
 
 
440 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  49.33 
 
 
474 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  48.17 
 
 
449 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  48.63 
 
 
450 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.31 
 
 
450 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  48.66 
 
 
455 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.62 
 
 
447 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.77 
 
 
447 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  48.98 
 
 
451 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  46.41 
 
 
453 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.65 
 
 
459 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  46.35 
 
 
492 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  50.56 
 
 
451 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  48.98 
 
 
472 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.21 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.14 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.02 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.29 
 
 
445 aa  356  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.93 
 
 
453 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  44.65 
 
 
451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.01 
 
 
442 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  49.31 
 
 
454 aa  349  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.8 
 
 
444 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  44.44 
 
 
436 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  43.38 
 
 
449 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  45.41 
 
 
443 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.44 
 
 
448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  44.97 
 
 
454 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.33 
 
 
431 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  45.33 
 
 
431 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  45.31 
 
 
431 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2522  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.52 
 
 
460 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102011  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  45.31 
 
 
431 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  45.31 
 
 
431 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2567  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.52 
 
 
457 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221251  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  45.31 
 
 
431 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  43.54 
 
 
448 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2559  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.52 
 
 
457 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  44.12 
 
 
441 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2456  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.08 
 
 
431 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00745552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.84 
 
 
495 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.84 
 
 
468 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>