22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4763 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  95.24 
 
 		 105 aa  203  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  95.24 
 
 		 105 aa  203  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  84.76 
 
 		 105 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  66.34 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  62.38 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  57.43 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  50.98 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  56.31 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  50.5 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  49.51 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  48.51 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  50.49 
 
 		 107 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  51.89 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  44.19 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  46.15 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  45.61 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  45.61 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4949  putative transcriptional regulator  38.37 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.463921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>