38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0289 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  84.55 
 
 
222 aa  387  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  85 
 
 
222 aa  387  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  39.44 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
1334 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  32.46 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  32.46 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  32.46 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  31.97 
 
 
378 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  29.26 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0250  hypothetical protein  28.95 
 
 
97 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0188439  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
1084 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0835  hypothetical protein  21.89 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  23.43 
 
 
518 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.25 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3032  hypothetical protein  28.89 
 
 
244 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  31.16 
 
 
190 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1839  hypothetical protein  23.74 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1779  hypothetical protein  25.47 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1814  hypothetical protein  23.45 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1764  hypothetical protein  23.45 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1585  hypothetical protein  23.45 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1613  hypothetical protein  23.45 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1635  hypothetical protein  23.45 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0150544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3565  hypothetical protein  24.68 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.876515  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1634  hypothetical protein  25.71 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  27.52 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  24.63 
 
 
204 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
1476 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  25.33 
 
 
209 aa  45.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1893  hypothetical protein  22.3 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00821908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 
988 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1486  hypothetical protein  36.67 
 
 
477 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  23.9 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
1152 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  25.15 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2733  glycosyltransferase-like protein  24.32 
 
 
329 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
1236 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>