More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3334 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  100 
 
 
301 aa  616  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3488  NAD(+)/NADH kinase family protein  67 
 
 
306 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000826356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0908  NAD(+)/NADH kinase family protein  64.63 
 
 
291 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.42987  normal  0.404915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1302  NAD(+)/NADH kinase family protein  62.93 
 
 
291 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1051  NAD(+)/NADH kinase family protein  61 
 
 
298 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1651  NAD(+)/NADH kinase family protein  60.47 
 
 
298 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3601  NAD(+)/NADH kinase family protein  60.67 
 
 
298 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  59.33 
 
 
298 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0904  NAD(+)/NADH kinase family protein  58.67 
 
 
298 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4336  NAD(+)/NADH kinase family protein  59.67 
 
 
303 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0833  NAD(+)/NADH kinase family protein  58.67 
 
 
298 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3285  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.75 
 
 
300 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178669  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.9 
 
 
318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.86 
 
 
312 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3318  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.4 
 
 
345 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3328  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.4 
 
 
345 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0731  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.79 
 
 
300 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.988053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1301  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.06 
 
 
299 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00867601  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3967  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.79 
 
 
300 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.52 
 
 
302 aa  322  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2332  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.06 
 
 
300 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0493  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.06 
 
 
300 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2213  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.06 
 
 
344 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.17 
 
 
312 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1106  NAD(+)/NADH kinase family protein  56.06 
 
 
320 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2504  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.79 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586186  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0714  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.45 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0260  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.45 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0744  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.45 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2640  NAD(+)/NADH kinase family protein  54.17 
 
 
300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42258  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0662  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.45 
 
 
300 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0638  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.45 
 
 
300 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3832  NAD(+)/NADH kinase family protein  53.1 
 
 
300 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0999  NAD(+)/NADH kinase family protein  55.9 
 
 
313 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.893596  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  52.08 
 
 
301 aa  289  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  52.78 
 
 
301 aa  288  6e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1725  NAD(+) kinase  45.55 
 
 
293 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.17125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  45.7 
 
 
294 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  43.45 
 
 
290 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  45.36 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  41.78 
 
 
290 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.49 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.49 
 
 
309 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.49 
 
 
292 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.49 
 
 
309 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.49 
 
 
309 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.12 
 
 
292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000370492  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.15 
 
 
309 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.75 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.15 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  43.15 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.32 
 
 
292 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.47 
 
 
309 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000702127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2573  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.1 
 
 
309 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000341976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2438  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.44 
 
 
292 aa  225  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3331  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.41 
 
 
307 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000815034  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3480  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.73 
 
 
292 aa  221  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0011597  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1384  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.69 
 
 
299 aa  218  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0162292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.41 
 
 
296 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  42.44 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  37.72 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  39.58 
 
 
303 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.08 
 
 
296 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1445  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.34 
 
 
299 aa  215  8e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00237626  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.88 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.64 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.74 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2163  ATP-NAD/AcoX kinase  38.21 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0199773 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.8 
 
 
294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.48 
 
 
293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1859  hypothetical protein  41.22 
 
 
290 aa  212  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.18 
 
 
298 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.08 
 
 
295 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02268  NAD kinase  38.19 
 
 
291 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.61 
 
 
295 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.84 
 
 
298 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.61 
 
 
295 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.34 
 
 
294 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.5 
 
 
292 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000258302  normal  0.101663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.02 
 
 
296 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.02 
 
 
296 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0611  ATP-dependent NAD kinase  35.15 
 
 
301 aa  207  2e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  40.34 
 
 
296 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2876  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.61 
 
 
295 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2738  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.61 
 
 
295 aa  205  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1190  NAD(+) kinase  39.38 
 
 
293 aa  205  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  36.49 
 
 
292 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3095  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.09 
 
 
292 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  normal  0.241472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02503  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.09 
 
 
292 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000896223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1060  ATP-NAD/AcoX kinase  37.09 
 
 
292 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000577429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3297  ATP-NAD/AcoX kinase  36.49 
 
 
292 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0523073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02467  hypothetical protein  37.09 
 
 
292 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000137745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3004  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.09 
 
 
292 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1069  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.09 
 
 
292 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0224782  normal  0.0704222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.21 
 
 
297 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2899  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.09 
 
 
292 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060122  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.09 
 
 
292 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000144313  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0612  ATP-NAD/AcoX kinase  38.72 
 
 
300 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2767  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.09 
 
 
292 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000128996  normal  0.109172 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0451  ATP-NAD kinase  38.72 
 
 
295 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>