33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2661 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2661  30S ribosomal protein S15P  100 
 
 
152 aa  307  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000175245  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0430  30S ribosomal protein S15P  71.05 
 
 
152 aa  225  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.515043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2235  30S ribosomal protein S15P  69.74 
 
 
152 aa  219  8e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2511  30S ribosomal protein S15P  71.05 
 
 
152 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0290  30S ribosomal protein S15P  69.08 
 
 
152 aa  218  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2345  30S ribosomal protein S15P  56.58 
 
 
152 aa  183  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000536573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1873  30S ribosomal protein S15P  57.24 
 
 
152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147777  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0606  30S ribosomal protein S15P  54.67 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0826  30S ribosomal protein S15P  52 
 
 
151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.468442  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1830  30S ribosomal protein S15P  52 
 
 
151 aa  160  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1091  30S ribosomal protein S15P  52 
 
 
151 aa  160  7e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.958151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0891  30S ribosomal protein S15P  49.33 
 
 
151 aa  158  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1376  Ribosomal S13S15 domain protein  50 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1401  Ribosomal S13S15 domain protein  50.32 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2134  Ribosomal S13S15 domain protein  49.35 
 
 
154 aa  141  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0780  30S ribosomal protein S15P  48.91 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0774456  normal  0.0146525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0725  30S ribosomal protein S15P  49.67 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2402  Ribosomal S13S15 domain protein  48.05 
 
 
156 aa  138  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1972  30S ribosomal protein S15P  47.97 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1173  30S ribosomal protein S15P  47.45 
 
 
151 aa  137  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0615  30S ribosomal protein S15P  48.34 
 
 
153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147077  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0515  30S ribosomal protein S15P  48.55 
 
 
148 aa  133  8e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2247  30S ribosomal protein S15P  46.9 
 
 
152 aa  131  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259397  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0598  30S ribosomal protein S15P  47.06 
 
 
150 aa  130  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1508  30S ribosomal protein S15P  43.92 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0335292 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0859  30S ribosomal protein S15P  48.84 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.844036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9199  predicted protein  42.38 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.646638  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1386  Ribosomal S13S15 domain protein  48.28 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.624256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0120  30S ribosomal protein S15P  44.91 
 
 
170 aa  125  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.081747  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02790  conserved hypothetical protein  41.72 
 
 
151 aa  125  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47482  predicted protein  41.06 
 
 
151 aa  120  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.202257 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40147  Ribosomal protein S13, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39.07 
 
 
152 aa  114  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06679  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s13 (Broad)  41.45 
 
 
151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.483621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>