31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0807 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  712    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  60 
 
 
346 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  32.47 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  31.66 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  31.75 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  32.34 
 
 
354 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  29.14 
 
 
356 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  28.98 
 
 
356 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  29.34 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  31.73 
 
 
361 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  27.73 
 
 
341 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  28.61 
 
 
357 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  26.2 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  27.56 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  24.92 
 
 
341 aa  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  25.89 
 
 
342 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  26.8 
 
 
346 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  24.21 
 
 
353 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  26.32 
 
 
346 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  25.74 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  26.76 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.93 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  23.64 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.59 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  23.84 
 
 
372 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  24.29 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.78 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.44 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  44.19 
 
 
335 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.48 
 
 
370 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>