11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0144 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0394  hypothetical protein  56.74 
 
 		 601 aa  653    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2286  abortive infection protein  58.11 
 
 		 601 aa  676    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0144  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 603 aa  1194    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0287244  decreased coverage  0.00361496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1463  hypothetical protein  51.65 
 
 		 604 aa  568  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1547  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  29.84 
 
 		 643 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1428  ABC-type transport system permease protein 1  35.07 
 
 		 650 aa  187  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.450402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2708  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0489598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  39.25 
 
 		 378 aa  44.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 367 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 366 aa  43.9  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>