9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1428 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1428  ABC-type transport system permease protein 1  100 
 
 		 650 aa  1246    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.450402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1547  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  46.27 
 
 		 643 aa  475  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2981  hypothetical protein  43.23 
 
 		 615 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2708  ABC-2 type transporter  52.52 
 
 		 610 aa  336  7e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0489598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0394  hypothetical protein  32.85 
 
 		 601 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0144  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 603 aa  223  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0287244  decreased coverage  0.00361496 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2286  abortive infection protein  30.09 
 
 		 601 aa  221  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1463  hypothetical protein  29.83 
 
 		 604 aa  203  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  26.09 
 
 		 370 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>