29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8346 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8346  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  64.29 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  75 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 250 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 250 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 250 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  78.79 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  70.59 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  73.53 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  59.52 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  70.59 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  58.14 
 
 		 250 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  60.98 
 
 		 268 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  59.09 
 
 		 267 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.89 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  56.1 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  56.1 
 
 		 268 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 247 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  65.71 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  57.14 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  57.14 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  63.64 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  64.52 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  63.64 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 104 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>