More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4942 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4942  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  76.54 
 
 		 247 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2551  integral membrane protein TerC  87.71 
 
 		 257 aa  359  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  72.69 
 
 		 250 aa  357  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  72.69 
 
 		 250 aa  357  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  72.76 
 
 		 250 aa  357  9e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1673  Integral membrane protein TerC  84.26 
 
 		 248 aa  354  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  71.77 
 
 		 250 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1566  integral membrane protein TerC  79.52 
 
 		 248 aa  351  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.22924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  71.49 
 
 		 254 aa  350  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  72 
 
 		 251 aa  349  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  77.5 
 
 		 247 aa  348  6e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  73.47 
 
 		 252 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  77.08 
 
 		 247 aa  345  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  70.56 
 
 		 249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  69.08 
 
 		 249 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1845  Integral membrane protein TerC  82.48 
 
 		 248 aa  339  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  72.46 
 
 		 271 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  73.58 
 
 		 255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  67.21 
 
 		 243 aa  328  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  69.39 
 
 		 251 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  69.39 
 
 		 251 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  72.46 
 
 		 253 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  69.87 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  69.76 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  71.37 
 
 		 251 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1196  integral membrane protein TerC  75 
 
 		 248 aa  318  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349001  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  71.61 
 
 		 267 aa  318  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4110  integral membrane protein TerC  79.57 
 
 		 256 aa  317  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4403  integral membrane protein TerC  69.8 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  71.19 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1135  TerC family membrane protein  73.19 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2908  inner membrane protein  73.19 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2752  TerC family membrane protein  73.19 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  69.69 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4488  Integral membrane protein TerC  69.39 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  69.92 
 
 		 251 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0807  hypothetical protein  69.39 
 
 		 250 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2902  integral membrane protein TerC  72.65 
 
 		 246 aa  311  9e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.807584  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  70.34 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  67.46 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1760  hypothetical protein  68.26 
 
 		 244 aa  294  9e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0537  integral membrane protein TerC  59.43 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  53.42 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  54.89 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  52.21 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  52.79 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  53.85 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 518 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  53.56 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.25 
 
 		 519 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.25 
 
 		 519 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  51.25 
 
 		 519 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.25 
 
 		 519 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  51.25 
 
 		 519 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  50.81 
 
 		 518 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  51 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  52.72 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  47.27 
 
 		 522 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  49.19 
 
 		 528 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  49.61 
 
 		 522 aa  244  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  50.83 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  50.83 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  50.83 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  50.83 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.83 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.83 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  55.08 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.83 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.83 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.83 
 
 		 516 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 577 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  51.05 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  48.81 
 
 		 518 aa  242  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  46.48 
 
 		 522 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  48.24 
 
 		 518 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 523 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  48.95 
 
 		 523 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  48.95 
 
 		 523 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  48.41 
 
 		 510 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  48.95 
 
 		 523 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  51.26 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  48.33 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  52.92 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  47.54 
 
 		 529 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  54.59 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  48.57 
 
 		 529 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  54.59 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  54.59 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  54.59 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  54.59 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 238 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  47.84 
 
 		 514 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  50 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  51.64 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  51.69 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  50.43 
 
 		 527 aa  232  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  50.83 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  50.41 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0874873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>