56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4915 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  93.89 
 
 		 181 aa  350  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  92.74 
 
 		 179 aa  349  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  87.71 
 
 		 179 aa  331  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  87.15 
 
 		 179 aa  329  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  87.15 
 
 		 179 aa  329  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  84.36 
 
 		 179 aa  322  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  75.84 
 
 		 178 aa  294  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  64.33 
 
 		 177 aa  247  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  66.06 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  64.46 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  63.69 
 
 		 177 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  58.96 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  41.67 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  42.26 
 
 		 211 aa  138  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  39.34 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  37.43 
 
 		 182 aa  121  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  37.43 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  36.87 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  36.9 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  40.96 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  36.99 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  35.62 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.3 
 
 		 396 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  37.88 
 
 		 393 aa  89.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.33 
 
 		 392 aa  87.8  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  34.36 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.62 
 
 		 393 aa  85.1  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  34.25 
 
 		 171 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  32.88 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  32.88 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  36.99 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.93 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.88 
 
 		 403 aa  79  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  32.19 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  32.88 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  32.88 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  31.69 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  38.1 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  34.44 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.62 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  32.88 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  36.91 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  29.45 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  29.59 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  33.58 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  27.4 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.51 
 
 		 393 aa  65.1  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  32.12 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  32.12 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  32.12 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  28.17 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  31.75 
 
 		 391 aa  50.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>