144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1043 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  100 
 
 
304 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  98.68 
 
 
304 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  66.89 
 
 
307 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  69 
 
 
305 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  59.54 
 
 
312 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  55.7 
 
 
318 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  54.22 
 
 
301 aa  308  5e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  59.66 
 
 
297 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  58.98 
 
 
297 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  58.98 
 
 
297 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  54.27 
 
 
348 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  53.27 
 
 
306 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  71.28 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  54.43 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  54.3 
 
 
301 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  54.1 
 
 
308 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  54.1 
 
 
308 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  54.1 
 
 
308 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  53.23 
 
 
310 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10740  hypothetical protein  51.95 
 
 
367 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.508563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  53.17 
 
 
308 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  45.66 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  47.42 
 
 
309 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  50.18 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  50.18 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  48.93 
 
 
317 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  50.18 
 
 
312 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10288  hypothetical protein  45.61 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59683e-26  normal  0.455495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  50 
 
 
309 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  52.75 
 
 
300 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  52.75 
 
 
300 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0910  putative methyltransferase  43 
 
 
295 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  52.75 
 
 
300 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10147  hypothetical protein  47.5 
 
 
310 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  41.25 
 
 
325 aa  202  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  45.93 
 
 
305 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  39.25 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  38.01 
 
 
278 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  42.73 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  39.3 
 
 
291 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  37.98 
 
 
312 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0089  hypothetical protein  40.81 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0098  putative methyltransferase  40.81 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.154609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2708  methyltransferase  36.43 
 
 
301 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0079  putative methyltransferase  40.81 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.331361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  38.6 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  42 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  35.27 
 
 
298 aa  138  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0168  putative methyltransferase  47.76 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3182  methyltransferase  41.87 
 
 
313 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  46.31 
 
 
242 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  46.31 
 
 
249 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  46.31 
 
 
249 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  33.98 
 
 
279 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0879  hypothetical protein  36.8 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0738  putative methyltransferase  48.28 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  38.28 
 
 
291 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  45.45 
 
 
798 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11917  hypothetical protein  59.32 
 
 
118 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  33.17 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  29.58 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  28.37 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  29.41 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30355  predicted protein  39.68 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  28.85 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  30.14 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  29.91 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  27.83 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  31.95 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  30.22 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  33.54 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  34.19 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  34.19 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  33.51 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  34.38 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  34.38 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  34.69 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  34.38 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  27.27 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  31.86 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  35.29 
 
 
285 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  31.88 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  29.57 
 
 
289 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
659 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
604 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  27.8 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
648 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  32.32 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  31.03 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  30.84 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  30.68 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
639 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  30.68 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  30.68 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  30.68 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  30.68 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  30.68 
 
 
286 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
630 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>