134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2708 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2708  methyltransferase  100 
 
 
301 aa  591  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  58.54 
 
 
298 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  51.42 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  41.61 
 
 
300 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  41.61 
 
 
300 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  41.61 
 
 
300 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  38.41 
 
 
348 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  41.22 
 
 
301 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  48.1 
 
 
303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  48.06 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  41.11 
 
 
278 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10288  hypothetical protein  39.65 
 
 
302 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59683e-26  normal  0.455495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  41.34 
 
 
307 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  40.22 
 
 
312 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  40.54 
 
 
301 aa  155  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  38.85 
 
 
305 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  37.38 
 
 
314 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  36.36 
 
 
304 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  36.88 
 
 
306 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  39.45 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  39.31 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  40.61 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  36.81 
 
 
304 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  36.81 
 
 
304 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  36.46 
 
 
304 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10147  hypothetical protein  41.71 
 
 
310 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  40.91 
 
 
308 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  40.91 
 
 
308 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  40.91 
 
 
308 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  38.13 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  46.19 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  39.71 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  42.6 
 
 
297 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  39.26 
 
 
297 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  39.26 
 
 
297 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  37.76 
 
 
291 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  36.84 
 
 
312 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  36.84 
 
 
312 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  36.84 
 
 
312 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10740  hypothetical protein  44.02 
 
 
367 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.508563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0910  putative methyltransferase  37.5 
 
 
295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  42.09 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  45.86 
 
 
301 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  40.91 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  37.45 
 
 
309 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  41.33 
 
 
310 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0168  putative methyltransferase  41.71 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  43.28 
 
 
798 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  41.52 
 
 
249 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  39.29 
 
 
249 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  40.94 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3182  methyltransferase  46.15 
 
 
313 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0079  putative methyltransferase  39.27 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.331361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0089  hypothetical protein  38.74 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0098  putative methyltransferase  38.74 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.154609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  35.11 
 
 
279 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0879  hypothetical protein  34.49 
 
 
329 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  37.13 
 
 
291 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0738  putative methyltransferase  35.71 
 
 
245 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  27.45 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  32.84 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  36.21 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30355  predicted protein  38.52 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  29.85 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  32.04 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  34.19 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  27 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  34.25 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0683  methyltransferase  33.14 
 
 
285 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  28.24 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  26.87 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  30.39 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  30.83 
 
 
301 aa  59.7  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
630 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
659 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
604 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
630 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
604 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
604 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
604 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  35.71 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  39.68 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  35.71 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  31.44 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  31.03 
 
 
285 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
639 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  30.67 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  35.19 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3430  hypothetical protein  29.65 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  31.19 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  30.57 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
648 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40430  hypothetical protein  29.65 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5836  putative methyltransferase  31.07 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  29.94 
 
 
287 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  30.95 
 
 
304 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0649  methyltransferase  34.46 
 
 
283 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  29.94 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  29.94 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  32.54 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>