39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1597 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  1088    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  49.41 
 
 
679 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0703  spore coat protein CotH  46.2 
 
 
663 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  42.41 
 
 
679 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  41.18 
 
 
709 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  35.8 
 
 
659 aa  326  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  33.59 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  47.04 
 
 
611 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  23.81 
 
 
564 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.19 
 
 
533 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  29.14 
 
 
536 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  25.1 
 
 
567 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3443  Spore coat protein CotH  27.42 
 
 
538 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  23.96 
 
 
495 aa  62  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3499  spore coat protein CotH  27.78 
 
 
400 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0747833  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  26.75 
 
 
819 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3453  Spore coat protein CotH  23.47 
 
 
798 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0950404  normal  0.13091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3062  Spore coat protein CotH  32.11 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139786  normal  0.977271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3168  Spore coat protein CotH  33.05 
 
 
661 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1553  hypothetical protein  34.65 
 
 
477 aa  50.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.494224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  21.28 
 
 
358 aa  50.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  21.28 
 
 
358 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  21.39 
 
 
358 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  21.97 
 
 
610 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0033  Spore coat protein CotH  25 
 
 
490 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  25.42 
 
 
569 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  21.07 
 
 
361 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  32.86 
 
 
368 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  32.86 
 
 
358 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  32.86 
 
 
368 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6689  Spore coat protein CotH  26.06 
 
 
500 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  32.86 
 
 
358 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  32.86 
 
 
358 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  32.86 
 
 
358 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  32.86 
 
 
358 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3317  spore coat assembly protein-like  27.88 
 
 
557 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3461  Spore coat protein CotH  27.88 
 
 
557 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0390465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3397  Spore coat protein CotH  27.88 
 
 
557 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  20.32 
 
 
673 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>