286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1149 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1149  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
238 aa  481  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1166  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  44.54 
 
 
227 aa  195  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1571  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  43.93 
 
 
244 aa  194  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1327  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  41.85 
 
 
225 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.46763 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0935  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  39.37 
 
 
249 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0119664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0313  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  42.6 
 
 
243 aa  161  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2249  peptidylprolyl isomerase  43.44 
 
 
254 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00467929  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0574  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.19 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0294  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.28 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0515  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.91 
 
 
320 aa  111  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1035  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.48 
 
 
243 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0806  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  36.42 
 
 
307 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507842  normal  0.49558 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1446  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.97 
 
 
253 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1667  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.73 
 
 
321 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0321  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.18 
 
 
225 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1591  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.44 
 
 
240 aa  98.6  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.684335  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3463  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.7 
 
 
323 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0054  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.97 
 
 
229 aa  94  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.650348  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2304  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.47 
 
 
320 aa  92.4  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0182084  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1475  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.53 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0305  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.38 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0020  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.76 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0051  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.52 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0543276 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1096  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.2 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1941  peptidylprolyl isomerase  32.43 
 
 
169 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1815  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.06 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1329  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.56 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.595094  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1730  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.75 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0756023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2256  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.24 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.638444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1940  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.79 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0459  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  26.99 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.136195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2255  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.56 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0437  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.14 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1483  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.14 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.364042  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0400  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.72 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.569021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1939  peptidylprolyl isomerase  31.43 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1328  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.78 
 
 
196 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.33601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2287  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.67 
 
 
157 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.11 
 
 
150 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.899429  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1395  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.33 
 
 
170 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.547343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1471  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.61 
 
 
152 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3325  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.63 
 
 
142 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3380  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.73 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3625  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.64 
 
 
150 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1013  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.08 
 
 
140 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.332237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0619  autotransporter protein  23.61 
 
 
160 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.757907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1171  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  31.09 
 
 
161 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3559  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.77 
 
 
150 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1905  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.85 
 
 
156 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1088  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  26.09 
 
 
156 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2886  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.9 
 
 
160 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163225  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0228  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative  27.15 
 
 
167 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0776  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  29.41 
 
 
161 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596082  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6484  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.14 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1009  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.41 
 
 
161 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0882  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.57 
 
 
161 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.832424  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4032  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.9 
 
 
147 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0801  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.41 
 
 
161 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320802 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0477  hypothetical protein  29.22 
 
 
147 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0174  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  24.07 
 
 
180 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000865218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0815  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.41 
 
 
161 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2267  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.87 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0359  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.81 
 
 
162 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0740624  normal  0.693438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1389  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.78 
 
 
142 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.179134  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2673  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.33 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.001969  hitchhiker  0.00926725 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0180  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  28.81 
 
 
162 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1145  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.45 
 
 
145 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1765  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  24.53 
 
 
151 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2113  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.78 
 
 
142 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2538  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.78 
 
 
142 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2027  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  31.93 
 
 
160 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000041603  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0586  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  26.92 
 
 
151 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.849063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3772  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  31.62 
 
 
155 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0819  putative FkpB-type peptidyl-prolyl cis- transisomerase  28.21 
 
 
151 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1101  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.56 
 
 
140 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0246  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  28.97 
 
 
142 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.89163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4557  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.01 
 
 
145 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506729  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2590  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.69 
 
 
162 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000202298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2629  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.69 
 
 
162 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000121302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3688  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.29 
 
 
159 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.285553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53430  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SlyD  30.25 
 
 
161 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174991  normal  0.0230622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2549  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  24.84 
 
 
165 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2256  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.8 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.247782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0817  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.97 
 
 
138 aa  52.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000748004  hitchhiker  0.0000000000247194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2704  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.69 
 
 
162 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4228  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.09 
 
 
144 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0257861  hitchhiker  0.00102854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1756  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.69 
 
 
162 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000092084  hitchhiker  0.00774334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3147  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.21 
 
 
151 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0769  hypothetical protein  30.83 
 
 
144 aa  52.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.546699  hitchhiker  0.00000753095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3199  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  31.25 
 
 
172 aa  52.8  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  0.0315977 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00982  hypothetical protein  34.62 
 
 
126 aa  52.4  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2955  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.56 
 
 
140 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0498263  normal  0.329752 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2710  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  26.39 
 
 
159 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00813042  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1660  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.21 
 
 
159 aa  52.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0932175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2140  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.33 
 
 
160 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000303836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0212  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.04 
 
 
164 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4683  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SlyD  29.41 
 
 
161 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0646  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.04 
 
 
145 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.255921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1359  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.78 
 
 
142 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0651  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.04 
 
 
145 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.228799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>