55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3143 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  100 
 
 		 182 aa  373  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  99.45 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  98.9 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  92.86 
 
 		 182 aa  357  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  93.41 
 
 		 182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  73.63 
 
 		 182 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  65.5 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  39.77 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  39.53 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  39.29 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  37.79 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  36.9 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  36.11 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  38.55 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  35.47 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  35.23 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  35.12 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  36.9 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  36.9 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  36.9 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  34.76 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.57 
 
 		 396 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  31.71 
 
 		 160 aa  88.2  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  29.88 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.33 
 
 		 392 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  29.63 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  26.9 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  27.49 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  26.17 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  26.35 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  25.5 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  23.46 
 
 		 393 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  25.75 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  25.75 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  27.71 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  25.75 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  30.49 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  28.49 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  26.35 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  27.44 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  23.46 
 
 		 403 aa  62  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  25.15 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  25.86 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  26.26 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  24.71 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  25.61 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  27.16 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  25 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  27.67 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  27.16 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  24.03 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  24.85 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  24.85 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  24.85 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  25 
 
 		 391 aa  42.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>