More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3093 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3093  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
180 aa  359  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2541  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  71.11 
 
 
181 aa  266  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0995  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  73.3 
 
 
178 aa  263  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.634062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4024  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  70.56 
 
 
182 aa  262  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3863  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68.33 
 
 
180 aa  262  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.419035  normal  0.0674381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68.33 
 
 
180 aa  261  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_004310  BR1985  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.16 
 
 
178 aa  260  7e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  72.16 
 
 
178 aa  260  7e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2197  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.54 
 
 
196 aa  219  1e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36411  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1156  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
195 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2981  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
189 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2861  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.48 
 
 
189 aa  214  6e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3087  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.48 
 
 
189 aa  214  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3996  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 
188 aa  210  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0023  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 
178 aa  208  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1597  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.77 
 
 
181 aa  204  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.896706  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3192  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
184 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
183 aa  151  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
183 aa  151  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
177 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
178 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
181 aa  148  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 
178 aa  147  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
178 aa  147  1e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
178 aa  147  1e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
178 aa  147  1e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
178 aa  147  1e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
182 aa  147  1e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
181 aa  146  1e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
182 aa  147  1e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  41.86 
 
 
178 aa  147  1e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
178 aa  147  1e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
178 aa  147  1e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
181 aa  146  1e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
177 aa  145  2e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
178 aa  146  2e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
178 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
178 aa  144  7e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
178 aa  144  7e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
178 aa  144  8e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
178 aa  144  8e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
178 aa  144  8e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4745  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
190 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.587694  decreased coverage  2.88771e-05 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  41.52 
 
 
176 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4309  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
190 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
169 aa  141  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
176 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
180 aa  141  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
176 aa  141  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
176 aa  141  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
176 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
179 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
180 aa  140  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
180 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
180 aa  140  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
180 aa  140  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
180 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
180 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
180 aa  140  1e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
181 aa  139  1e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
175 aa  139  2e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
175 aa  139  2e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1606  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
180 aa  139  2e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
175 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
189 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
183 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
176 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
175 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
174 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.69861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
183 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
175 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
175 aa  138  4e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
175 aa  138  4e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
180 aa  138  4e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
175 aa  138  5e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
175 aa  138  5e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
180 aa  137  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
181 aa  137  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
180 aa  137  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
190 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
180 aa  137  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.22 
 
 
186 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684921  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 
180 aa  137  8e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 
176 aa  137  8e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
176 aa  137  9e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
176 aa  137  9e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
176 aa  137  9e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1428  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.22 
 
 
181 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0375844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 
179 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0403  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
179 aa  136  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  4.07024e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
176 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2786  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.22 
 
 
181 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0223963  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
176 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
176 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2897  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
180 aa  135  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2230  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
179 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 
186 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02020  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
199 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.99226e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
181 aa  134  6e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
178 aa  134  6e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>