More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2347 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2347  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000160523  normal  0.064665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0159  nitrogen regulatory protein P-II  68.1 
 
 		 114 aa  160  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.55 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  51.72 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.28 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  48.28 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  51.72 
 
 		 113 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.55 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  48.28 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301067  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  49.14 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  48.28 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  43.97 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.41 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000155222  normal  0.138498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  46.55 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  48.28 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.41 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.97 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.55 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  47.41 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  43.97 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  47.41 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  43.97 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  46.55 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.83 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  95.9  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  44.83 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  45.69 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>