More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0682 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 129 aa  259  1e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  87.6 
 
 		 129 aa  229  7.000000000000001e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  61.24 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  59.69 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  59.54 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  59.69 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 		 132 aa  146  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  56.69 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  56.69 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  56.69 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  56.69 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  56.69 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  56.69 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  56.69 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  56.69 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  56.59 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  58.14 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  56.15 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  56.25 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  55.04 
 
 		 132 aa  143  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  59.54 
 
 		 131 aa  144  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  58.59 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 132 aa  143  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  56.25 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0615  ribosomal protein S8  53.12 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  54.26 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  54.33 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  54.33 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  58.59 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  54.33 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  55.81 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  55.91 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  54.33 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  54.26 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  54.33 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  55.12 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  59.23 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  54.33 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  52.71 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  59.38 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  53.54 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  56.59 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  51.94 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1003  30S ribosomal protein S8  49.6 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  55.47 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  51.94 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  52.38 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>