More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0659 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
802 aa  913    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
906 aa  746    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
819 aa  719    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
854 aa  769    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
806 aa  778    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
858 aa  799    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 
804 aa  950    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
824 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
802 aa  912    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
814 aa  658    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
838 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
833 aa  887    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
805 aa  939    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
802 aa  910    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
802 aa  910    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  70.77 
 
 
801 aa  1205    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
802 aa  910    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
805 aa  910    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
800 aa  715    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
814 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
807 aa  796    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
805 aa  766    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
816 aa  671    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
805 aa  785    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  46.75 
 
 
899 aa  752    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
824 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
857 aa  714    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
802 aa  910    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
806 aa  906    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
819 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
824 aa  672    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
817 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
804 aa  1652    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
829 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
858 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
802 aa  912    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
936 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
805 aa  793    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
802 aa  910    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
806 aa  813    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  44.46 
 
 
879 aa  726    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
840 aa  744    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
819 aa  639    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 
805 aa  940    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
807 aa  751    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
817 aa  682    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
805 aa  910    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
816 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
816 aa  666    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
824 aa  653    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
857 aa  714    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 
802 aa  904    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 
802 aa  910    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
828 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
824 aa  658    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
804 aa  910    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
830 aa  681    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
829 aa  867    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
829 aa  854    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
804 aa  872    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
808 aa  867    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
833 aa  895    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
801 aa  735    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
824 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
816 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
806 aa  909    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
802 aa  909    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
825 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
823 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
816 aa  756    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
824 aa  642    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
835 aa  713    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
823 aa  639    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
810 aa  682    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
824 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
934 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
824 aa  633  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
828 aa  632  1e-180  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
971 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
825 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
971 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
829 aa  635  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
971 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
950 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
838 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
872 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
827 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
949 aa  632  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
875 aa  629  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
832 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
958 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2911  leucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
832 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.084861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
851 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
829 aa  628  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
826 aa  626  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
827 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
829 aa  625  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
954 aa  624  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12480  leucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
835 aa  624  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
968 aa  624  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>