37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0259 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0259  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl224  hypothetical protein  59.02 
 
 
207 aa  242  3e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  27.93 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  25.7 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  26.67 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  29.57 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  30.85 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  26.29 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  28.25 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1768  hypothetical protein  29.7 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.712732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  25.77 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  27.04 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  25.77 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  25.77 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  25.77 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  26.11 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  25.77 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  25.56 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  29.17 
 
 
209 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  26.26 
 
 
213 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0767  thiamine pyrophosphokinase  24.39 
 
 
222 aa  52  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566188  hitchhiker  0.0000000481128 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  27.98 
 
 
209 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  23.75 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  23.75 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  31.05 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  26.78 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  27.92 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  27.03 
 
 
203 aa  48.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  27.32 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  25.88 
 
 
211 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  23.08 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  24.73 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  24.73 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  26.4 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  25.39 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  33.75 
 
 
219 aa  45.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  31.11 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>