171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03415 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03415  ApaG  100 
 
 		 124 aa  259  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  60.87 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  47.9 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  45.97 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  47.5 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  47.5 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  48.74 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  47.9 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  48.74 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  45.97 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  48.74 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  123  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  123  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  123  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  123  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  123  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  123  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  48.39 
 
 		 185 aa  123  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  48.74 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  48.39 
 
 		 185 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  48.74 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  49.19 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  47.06 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  46.77 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  48.39 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  45.38 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  121  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  48.39 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  45.38 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  42.74 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  45.16 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  45.38 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  47.06 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  45.76 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001666  ApaG protein  44.44 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  46.67 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  48.39 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  47.58 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  47.58 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  46.22 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00807  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  48.28 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  46.22 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  46.03 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  44.54 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  48.28 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  45.38 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  45.38 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  45.97 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  45.97 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  49.57 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  45 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  45.38 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  45.24 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  45.16 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  44.54 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  43.7 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  43.7 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  46.03 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  44.92 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  46.09 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  44.44 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  44.54 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  43.09 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  46.15 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0921  ApaG  43.09 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.116399  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  46.61 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  42.86 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  45.22 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  44.54 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  42.02 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  42.5 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  45.54 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  42.02 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  42.5 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  42.86 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>