48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1438 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  41.03 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  41.1 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  39.74 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  43.24 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  41.67 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  38.89 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0490  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000900641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0487  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000002687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0466  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000739571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3853  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000215717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  35.62 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0542  hypothetical protein  34.33 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0502225  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0446  hypothetical protein  34.33 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00475096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2075  hypothetical protein  44.64 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0910666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  32.84 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  32.84 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  32.84 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  31.58 
 
 		 78 aa  47.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1796  hypothetical protein  44.64 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0459  hypothetical protein  35.82 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  28 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  34.25 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  36 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  34.38 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  38.46 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  35.94 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  32.88 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2236  hypothetical protein  41.33 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  29.85 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  36.49 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  33.82 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  34.38 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  33.78 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0411  hypothetical protein  31.34 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0459  hypothetical protein  31.25 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  38.46 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  35.94 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  31.94 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  42  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  32.43 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  31.25 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  30.56 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  29.49 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  29.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  33.87 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3391  hypothetical protein  31.34 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000297352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>