20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2284 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  100 
 
 		 158 aa  318  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  38.3 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  38.85 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  31.85 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  33.77 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  34.81 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  34.97 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  36.69 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  35.51 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  37.41 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  32.62 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  32.62 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  32.09 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  28.68 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3768  hypothetical protein  29.1 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  33.77 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  26.04 
 
 		 211 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1653  bacteriophage protein  30.88 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  24.84 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>