30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0225 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  795  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  58.9 
 
 
391 aa  447  1e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  56.23 
 
 
391 aa  439  1e-122  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  55.05 
 
 
404 aa  440  1e-122  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  55.61 
 
 
391 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  55.05 
 
 
397 aa  427  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  54.31 
 
 
392 aa  417  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  53.51 
 
 
403 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  53.32 
 
 
391 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  51.51 
 
 
401 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  53.15 
 
 
441 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  51.76 
 
 
405 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  51.26 
 
 
395 aa  356  4e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  50.64 
 
 
395 aa  337  2e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  36.22 
 
 
394 aa  234  2e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  37.24 
 
 
384 aa  215  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  38.75 
 
 
387 aa  159  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  56.59 
 
 
145 aa  154  3e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  30.18 
 
 
398 aa  127  4e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  30.5 
 
 
429 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  31.17 
 
 
413 aa  112  1e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  31.37 
 
 
426 aa  103  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  25.86 
 
 
384 aa  74.3  3e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  30 
 
 
408 aa  73.9  4e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  24.34 
 
 
394 aa  73.2  7e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  24.81 
 
 
381 aa  60.1  6e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.57228e-12  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  49.38 
 
 
101 aa  58.5  2e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  24.68 
 
 
383 aa  51.2  4e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  47.14 
 
 
92 aa  50.4  6e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  27.39 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>