More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2065 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  100 
 
 
44 aa  86.3  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  2.17746e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  93.18 
 
 
44 aa  80.5  8e-15  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  90.91 
 
 
44 aa  80.5  8e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  88.37 
 
 
54 aa  75.5  2e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  6.11674e-14  hitchhiker  3.51801e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  84.09 
 
 
44 aa  70.5  7e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.542e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.65607e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.1  8e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  69.3  2e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  68.9  2e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  1.66725e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  68.9  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 
44 aa  67.4  6e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  63.9  7e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.29596e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 
44 aa  63.5  1e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  3.43039e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  72.73 
 
 
51 aa  63.2  1e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  1e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  3.90368e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  74.42 
 
 
52 aa  63.2  1e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  1.48872e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  63.2  1e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  3.18423e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  72.09 
 
 
44 aa  62  2e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  6.49644e-07  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  62.8  2e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  72.73 
 
 
52 aa  62  2e-09  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  62  3e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  4.18324e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  61.6  3e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
52 aa  62  3e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  60.8  5e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  61.2  5e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
46 aa  61.2  5e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  61.2  5e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  60.8  6e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  7e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
55 aa  60.8  7e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
53 aa  60.1  9e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  59.7  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.67166e-13  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
53 aa  59.7  1e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  9.16972e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  70.45 
 
 
48 aa  59.7  1e-08  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  59.3  1e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.49089e-06  hitchhiker  1.10171e-09 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  59.7  1e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  59.3  2e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  58.9  2e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  58.5  3e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  67.44 
 
 
52 aa  58.5  3e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  58.2  3e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  57.8  4e-08  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.55667e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  58.2  4e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  71.43 
 
 
44 aa  57.8  4e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
48 aa  58.2  4e-08  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
46 aa  57.8  4e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  57.8  5e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  57.4  6e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  57.4  6e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  57.4  6e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 
44 aa  57.4  6e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
52 aa  57.4  6e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  57.4  6e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  57.4  6e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  57.4  6e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
50 aa  57.4  6e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  57.4  6e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  2.417e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  57.4  6e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  57.4  7e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  57.4  7e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  57.4  7e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  57  8e-08  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
46 aa  57  8e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  57  8e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  57  9e-08  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  57  9e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  57  9e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  57  9e-08  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
46 aa  57  9e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  56.6  1e-07  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
49 aa  56.2  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
51 aa  56.6  1e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  56.2  1e-07  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
53 aa  56.6  1e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  1.89497e-09  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
53 aa  55.5  2e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  68.18 
 
 
44 aa  55.8  2e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
45 aa  55.5  2e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.97783e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  56.2  2e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  55.8  2e-07  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  65.12 
 
 
52 aa  55.8  2e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  2.2911e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0301  ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  55.1  3e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  63.64 
 
 
44 aa  55.1  3e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  65.91 
 
 
53 aa  55.1  3e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  55.1  4e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  63.64 
 
 
44 aa  55.1  4e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  4.1199e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  54.7  4e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
47 aa  54.7  4e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1923  ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  54.7  4e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360923  normal  0.510099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  54.7  4e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 
44 aa  54.7  4e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  55.1  4e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.398714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>