33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0866 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  736    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  44.86 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  39.4 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  34.5 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  34.64 
 
 		 360 aa  189  9e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  27.79 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  27.22 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  27.79 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  25.44 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  22.64 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  23.89 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  28.07 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  28.09 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  24.66 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  31.15 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  24.71 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  27.4 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  24.53 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  25.22 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  22.01 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  23.7 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  23.97 
 
 		 599 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  22.66 
 
 		 451 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  23.79 
 
 		 446 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  25.08 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  22.07 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  22.07 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  31.15 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  23.57 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  27.05 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  20.47 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  21.89 
 
 		 381 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  23.28 
 
 		 436 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>