281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0427 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0427  Acyl carrier protein phosphodiesterase  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.319944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  38.28 
 
 
208 aa  154  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  38.28 
 
 
208 aa  154  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  40.09 
 
 
212 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  40.72 
 
 
208 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  40.72 
 
 
208 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  40.72 
 
 
208 aa  147  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  40.72 
 
 
208 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  40.72 
 
 
208 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  40.72 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  40 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  38.78 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  39.29 
 
 
211 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  39.29 
 
 
211 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  39.49 
 
 
208 aa  144  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  39.69 
 
 
208 aa  143  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  39.49 
 
 
208 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  39.29 
 
 
211 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  38.78 
 
 
211 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  38.78 
 
 
211 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  36.97 
 
 
211 aa  141  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  38.78 
 
 
211 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  38.78 
 
 
211 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  38.78 
 
 
211 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  38.78 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  37.98 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  37.5 
 
 
208 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  37.5 
 
 
208 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  37.5 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  37.5 
 
 
230 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4960600000000002e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  37.5 
 
 
208 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  37.02 
 
 
230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  37.02 
 
 
230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.24 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  34.13 
 
 
230 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  35.1 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000156707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 
210 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 
210 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.945859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  37.75 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.23 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  41.3 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 
232 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  40.76 
 
 
201 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.76 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  40.76 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  40.76 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  40.76 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  40.76 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  40.76 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  39.67 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  39.67 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  39.67 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  39.67 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  39.67 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.98 
 
 
199 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  37.77 
 
 
201 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.42 
 
 
198 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.3 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0988  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.11 
 
 
198 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  38.04 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  36.13 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.08 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  39.13 
 
 
201 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  36.17 
 
 
201 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.67 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0871  acyl carrier protein phosphodiesterase 3; NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.82 
 
 
213 aa  111  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  38.59 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  38.59 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  38.59 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0908  hypothetical protein  34.3 
 
 
220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.52 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0966  hypothetical protein  34.3 
 
 
220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  37.64 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  38.04 
 
 
201 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.17 
 
 
206 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1070  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.78 
 
 
213 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.04 
 
 
196 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.05 
 
 
213 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.17 
 
 
213 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.67 
 
 
216 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0881  Acyl carrier protein phosphodiesterase  40.62 
 
 
161 aa  105  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.96 
 
 
216 aa  104  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.67 
 
 
216 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35 
 
 
182 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
215 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.52 
 
 
203 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.71 
 
 
195 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3584  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
197 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000358393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  33.67 
 
 
197 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  34.59 
 
 
203 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.97 
 
 
204 aa  101  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.41 
 
 
198 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.41 
 
 
198 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.57 
 
 
203 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.52 
 
 
202 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>