40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  901  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  37.93 
 
 
411 aa  221  2e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82332e-08 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  36.93 
 
 
414 aa  219  9e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  41.36 
 
 
396 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  38.37 
 
 
400 aa  197  5e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  36.64 
 
 
400 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  36.51 
 
 
438 aa  184  4e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  37.59 
 
 
418 aa  184  4e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  35.79 
 
 
412 aa  180  5e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  35.96 
 
 
422 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  37.69 
 
 
443 aa  171  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  34.59 
 
 
388 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  39 
 
 
428 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  34.34 
 
 
388 aa  146  7e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  34.74 
 
 
423 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  34.61 
 
 
428 aa  141  2e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  39.29 
 
 
411 aa  133  7e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  34.11 
 
 
403 aa  129  2e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  31.19 
 
 
396 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  28.54 
 
 
392 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  41.89 
 
 
415 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  30.92 
 
 
477 aa  94  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  30.95 
 
 
487 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  26.09 
 
 
385 aa  83.6  7e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  45.28 
 
 
407 aa  82.4  2e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  31.84 
 
 
399 aa  78.2  3e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  29.09 
 
 
399 aa  77.4  5e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  30.22 
 
 
416 aa  76.3  1e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  3.64534e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  30.81 
 
 
383 aa  70.9  5e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  26.68 
 
 
382 aa  68.2  3e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  23.92 
 
 
407 aa  66.6  9e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  32.19 
 
 
444 aa  66.6  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  33.96 
 
 
420 aa  63.5  8e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  23.04 
 
 
399 aa  60.5  7e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  27.48 
 
 
412 aa  58.2  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  27.48 
 
 
412 aa  58.2  3e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  27.48 
 
 
369 aa  57.4  6e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  26.33 
 
 
372 aa  53.9  6e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  35.25 
 
 
402 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  31.85 
 
 
401 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>