39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02650 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02650    100 
 
 
123 bp  244  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  91.07 
 
 
1317 bp  143  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  91.07 
 
 
1317 bp  143  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  89.29 
 
 
1317 bp  127  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  89.29 
 
 
1317 bp  127  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  88.76 
 
 
1308 bp  97.6  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  88.76 
 
 
1308 bp  97.6  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  88.76 
 
 
1308 bp  97.6  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  88.76 
 
 
1308 bp  97.6  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  88.76 
 
 
1308 bp  97.6  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17100    88.76 
 
 
2292 bp  97.6  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0207297  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  92.54 
 
 
1353 bp  93.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  85.59 
 
 
1317 bp  93.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  92.54 
 
 
1353 bp  93.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  87.64 
 
 
1308 bp  89.7  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  87.64 
 
 
1308 bp  89.7  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0230    86.32 
 
 
1328 bp  85.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0928078  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  88.61 
 
 
1308 bp  85.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  86.32 
 
 
1137 bp  85.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  88.61 
 
 
936 bp  85.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  88.61 
 
 
1308 bp  85.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07920    85.15 
 
 
1267 bp  81.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  85.15 
 
 
1329 bp  81.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00920    85.15 
 
 
1261 bp  81.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05280    85.15 
 
 
1297 bp  81.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05340    85.15 
 
 
1267 bp  81.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  83.33 
 
 
1089 bp  79.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    84.47 
 
 
2767 bp  77.8  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  84.47 
 
 
1356 bp  77.8  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  83.33 
 
 
1041 bp  67.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  83.33 
 
 
1332 bp  67.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  84.44 
 
 
1311 bp  67.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  82.35 
 
 
1332 bp  60  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  85.48 
 
 
1311 bp  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  85.48 
 
 
1311 bp  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  85.48 
 
 
1311 bp  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4443    86.27 
 
 
560 bp  46.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  89.74 
 
 
1317 bp  46.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  89.74 
 
 
1317 bp  46.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>