29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00970    100 
 
 
231 bp  458  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  94.31 
 
 
957 bp  323  1e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    97.74 
 
 
3818 bp  319  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  92.41 
 
 
1077 bp  109  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  92.41 
 
 
1077 bp  109  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  92.41 
 
 
1077 bp  109  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  92.41 
 
 
1077 bp  109  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  92.41 
 
 
1077 bp  109  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  88.04 
 
 
990 bp  95.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  88.04 
 
 
990 bp  95.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  88.04 
 
 
990 bp  95.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20950    80.88 
 
 
351 bp  95.6  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  90.67 
 
 
990 bp  93.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  88.75 
 
 
999 bp  87.7  1e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  88.75 
 
 
999 bp  87.7  1e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  89.19 
 
 
1269 bp  83.8  2e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  87.5 
 
 
987 bp  79.8  3e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3645    86.05 
 
 
309 bp  75.8  5e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0685    87.32 
 
 
992 bp  69.9  3e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  87.69 
 
 
1446 bp  65.9  5e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  88.33 
 
 
993 bp  63.9  2e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  2.89484e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  88.33 
 
 
993 bp  63.9  2e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  88.33 
 
 
1044 bp  63.9  2e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  88.33 
 
 
993 bp  63.9  2e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  88.33 
 
 
993 bp  63.9  2e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5281  histidine kinase  83.72 
 
 
456 bp  60  3e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263883  normal  0.386303 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  83.72 
 
 
456 bp  60  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  81.82 
 
 
987 bp  60  3e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15100    87.23 
 
 
1065 bp  46.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>